285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3183 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  99.19 
 
 
247 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  99.19 
 
 
247 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  97.98 
 
 
247 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  97.98 
 
 
247 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  44.92 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  44.92 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  44.92 
 
 
242 aa  199  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0807  periplasmic pilus chaperone family protein  41.1 
 
 
243 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  41.74 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0765  periplasmic pilus chaperone family protein  40.72 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2938  pili assembly chaperone  40.27 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0743  periplasmic pilus chaperone family protein  40.27 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0634  periplasmic pilus chaperone family protein  40.27 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00677  predicted assembly protein  39.37 
 
 
243 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.81 
 
 
242 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  41.38 
 
 
250 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  41.38 
 
 
250 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  37.87 
 
 
239 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  40.18 
 
 
255 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  37.87 
 
 
239 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  38.03 
 
 
251 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  40.95 
 
 
250 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  38.3 
 
 
239 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  39.35 
 
 
252 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  41.18 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  41.18 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.21 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  38.37 
 
 
248 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00666  hypothetical protein  38.86 
 
 
220 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  40.72 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  38.84 
 
 
248 aa  158  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  36.82 
 
 
252 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  35.68 
 
 
257 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  35.68 
 
 
257 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  35.68 
 
 
257 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  35.68 
 
 
257 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.315924 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.33 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  37.33 
 
 
250 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  39.53 
 
 
263 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  39.08 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  37.5 
 
 
249 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.5 
 
 
249 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  37.5 
 
 
249 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.2 
 
 
249 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  38.99 
 
 
241 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  38.24 
 
 
230 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  36.17 
 
 
249 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3223  periplasmic pilus chaperone family protein  38.03 
 
 
249 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000604612  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0652  pili assembly chaperone  37.61 
 
 
249 aa  148  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  38.6 
 
 
246 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  38.6 
 
 
249 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  38.6 
 
 
249 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  38.6 
 
 
249 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  38.6 
 
 
249 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  38.6 
 
 
249 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0216  chaperone protein PapD  34.07 
 
 
250 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000206765  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0234  chaperone protein PapD  34.07 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0011245  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0233  chaperone protein PapD  33.63 
 
 
250 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0218  chaperone protein PapD  33.63 
 
 
250 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000225767  normal  0.548646 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  38.01 
 
 
241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  37.56 
 
 
241 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  37.56 
 
 
241 aa  135  8e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  37.56 
 
 
241 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.9 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.1 
 
 
241 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  38.65 
 
 
216 aa  131  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.77 
 
 
231 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  34.96 
 
 
236 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  34.96 
 
 
236 aa  124  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  33.33 
 
 
231 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  33.77 
 
 
231 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  33.77 
 
 
231 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  33.77 
 
 
231 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  33.77 
 
 
231 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  34.8 
 
 
229 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  33.94 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  34.93 
 
 
232 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  34.93 
 
 
232 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  34.93 
 
 
232 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  34.48 
 
 
234 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  34.93 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  35.09 
 
 
248 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  32.93 
 
 
245 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  34.27 
 
 
227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  34.43 
 
 
227 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  32.43 
 
 
227 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.19 
 
 
243 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  33.02 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  34.78 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  33.02 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  33.65 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  31.92 
 
 
233 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  37.89 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  32.03 
 
 
227 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  32.03 
 
 
227 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  32.03 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  32.23 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  32.03 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  32.03 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>