287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0315 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  100 
 
 
249 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  100 
 
 
249 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  99.6 
 
 
249 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  100 
 
 
249 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  99.2 
 
 
249 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  99.59 
 
 
246 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  77.31 
 
 
248 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  76.57 
 
 
248 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  78.18 
 
 
248 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  73.39 
 
 
248 aa  358  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  73.39 
 
 
263 aa  357  8e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  76.96 
 
 
263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  76.04 
 
 
248 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  43.17 
 
 
251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.43 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  42.79 
 
 
239 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  42.79 
 
 
239 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  42.6 
 
 
239 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  38.87 
 
 
250 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  40.26 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  40.26 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  40.26 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  40.26 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  39.59 
 
 
252 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  40.89 
 
 
252 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  41.78 
 
 
255 aa  182  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  38.89 
 
 
250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  38.89 
 
 
250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.34 
 
 
249 aa  178  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  39.53 
 
 
250 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  38.46 
 
 
250 aa  176  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.07 
 
 
250 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  38.71 
 
 
250 aa  175  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0233  chaperone protein PapD  40.44 
 
 
250 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0216  chaperone protein PapD  40.44 
 
 
250 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000206765  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0234  chaperone protein PapD  40.44 
 
 
250 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0011245  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0218  chaperone protein PapD  40.44 
 
 
250 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000225767  normal  0.548646 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  36.75 
 
 
242 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  36.75 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  36.75 
 
 
249 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  39.9 
 
 
230 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  37.67 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  35.24 
 
 
249 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  38.24 
 
 
247 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  35.24 
 
 
249 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.24 
 
 
249 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  35.24 
 
 
249 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  38.24 
 
 
247 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  38.24 
 
 
247 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  38.24 
 
 
247 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  38.24 
 
 
247 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0652  pili assembly chaperone  35.24 
 
 
249 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3223  periplasmic pilus chaperone family protein  35.24 
 
 
249 aa  155  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000604612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.04 
 
 
242 aa  151  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0765  periplasmic pilus chaperone family protein  35.78 
 
 
243 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00677  predicted assembly protein  33.94 
 
 
243 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2938  pili assembly chaperone  34.7 
 
 
243 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0743  periplasmic pilus chaperone family protein  34.7 
 
 
243 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0634  periplasmic pilus chaperone family protein  34.7 
 
 
243 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00666  hypothetical protein  33.49 
 
 
220 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0807  periplasmic pilus chaperone family protein  32.61 
 
 
243 aa  141  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04795  chaperone PapD  33.49 
 
 
239 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  30.97 
 
 
227 aa  128  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  35.51 
 
 
237 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  35.51 
 
 
230 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  35.51 
 
 
230 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  35.51 
 
 
230 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  31.94 
 
 
243 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  35.05 
 
 
230 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.72 
 
 
243 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.16 
 
 
234 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  31.8 
 
 
243 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  34.11 
 
 
236 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  38.64 
 
 
229 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  32.91 
 
 
241 aa  122  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  31.84 
 
 
249 aa  122  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  33.64 
 
 
236 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  35.98 
 
 
246 aa  121  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  33.88 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  34.47 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  31.16 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  33.73 
 
 
248 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  33.04 
 
 
234 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.81 
 
 
243 aa  118  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.86 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  33.79 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  32.72 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  35.17 
 
 
251 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  36.99 
 
 
232 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  32.88 
 
 
247 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  36.99 
 
 
232 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  36.99 
 
 
232 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.33 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  36.99 
 
 
232 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  33.33 
 
 
241 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  32.88 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  35.96 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  35.04 
 
 
248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  33.64 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  35.96 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>