284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2495 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  100 
 
 		 250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  75.1 
 
 		 250 aa  394  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  75.1 
 
 		 250 aa  394  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  72 
 
 		 252 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  74.29 
 
 		 250 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  77.83 
 
 		 250 aa  378  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  76.47 
 
 		 241 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  76.92 
 
 		 250 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  78.11 
 
 		 230 aa  339  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0216  chaperone protein PapD  62.28 
 
 		 250 aa  301  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000206765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0233  chaperone protein PapD  62.28 
 
 		 250 aa  301  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0234  chaperone protein PapD  62.28 
 
 		 250 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0011245  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0218  chaperone protein PapD  62.28 
 
 		 250 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000225767  normal  0.548646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  51.85 
 
 		 251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  51.05 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  51.05 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  51.05 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  51.05 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  54.55 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  49.17 
 
 		 255 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  47.19 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  47.19 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  46.49 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  47.06 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  44.26 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  43.35 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  42.62 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.83 
 
 		 248 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  42.92 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  42.62 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  42.62 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.56 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  43.32 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  43.32 
 
 		 263 aa  185  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  42.73 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.75 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.17 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00677  predicted assembly protein  40.09 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0765  periplasmic pilus chaperone family protein  39.66 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  39.07 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  39.07 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  39.07 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2938  pili assembly chaperone  40.09 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  39.07 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  39.07 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  39.07 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0743  periplasmic pilus chaperone family protein  40.09 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0634  periplasmic pilus chaperone family protein  40.09 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0807  periplasmic pilus chaperone family protein  40.44 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00666  hypothetical protein  40.74 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  37.83 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  39.08 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  40.55 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  40.55 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.55 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3223  periplasmic pilus chaperone family protein  39.63 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000604612  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0652  pili assembly chaperone  39.17 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  38.66 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  38.66 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  38.24 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  38.24 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04795  chaperone PapD  35.75 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  32.77 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  32.88 
 
 		 249 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  35.75 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  36.79 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  32.4 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  33.91 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  35.89 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  34.87 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  35.02 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  35.02 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.78 
 
 		 243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  35.02 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  33.91 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  34.22 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  34.87 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  34.22 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.34 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  34.45 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  32.61 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  32.63 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.29 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  39.41 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  33.33 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  34.04 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  31.43 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  32.88 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  31.7 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  33.33 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.33 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  34.03 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  33.33 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  33.33 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2385  gram-negative pilus assembly chaperone  34.53 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.560587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  32.79 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  34.5 
 
 		 224 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2296  gram-negative pilus assembly chaperone  34.53 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  33.96 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  32.22 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>