281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6668 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  100 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  73.36 
 
 		 243 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  65.53 
 
 		 236 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  67.54 
 
 		 241 aa  315  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  64.08 
 
 		 245 aa  315  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  66.67 
 
 		 240 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  47.23 
 
 		 245 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  48.31 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  47.92 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  47.06 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  46.55 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  48.52 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  47.88 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  48.52 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  47.88 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  44.86 
 
 		 250 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  48.31 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  48.1 
 
 		 246 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  43.11 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  43.11 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  43.11 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  43.67 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  44.35 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  43.86 
 
 		 248 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  47.91 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  44.44 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  42.67 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  41.77 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.7 
 
 		 243 aa  181  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.21 
 
 		 266 aa  178  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  43.21 
 
 		 266 aa  178  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  43.12 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  42.28 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  41.41 
 
 		 234 aa  174  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  40 
 
 		 245 aa  172  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  40 
 
 		 245 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  48.23 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  39.57 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  38.39 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  47.5 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  40.42 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  45.28 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  37.93 
 
 		 267 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  37.93 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  37.93 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  37.93 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  37.93 
 
 		 309 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  40.28 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  38.79 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  37 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  36.84 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  39.35 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.35 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  34.93 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  36.91 
 
 		 252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  36.05 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  34.65 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  37.14 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  37.61 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  36.02 
 
 		 242 aa  148  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  36.32 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  34.21 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  34.21 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  38.67 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.43 
 
 		 266 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  37.45 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  38.26 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  38.43 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  38.43 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  38.43 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  38.77 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  38.53 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  37.33 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  38.12 
 
 		 234 aa  138  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  39.47 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  39.38 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0023  pili assembly chaperone  32.49 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000753719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.81 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  35.12 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  39.08 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  39.08 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  39.08 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.39 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  32.47 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  32.47 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  34.47 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  39.57 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  39.08 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  33.47 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  39.57 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  35.57 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.57 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  35.57 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  35.57 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  36.48 
 
 		 230 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  38.22 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2109  pili assembly chaperone  33.92 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0135661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2296  gram-negative pilus assembly chaperone  37.63 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  36.48 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  36.48 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>