266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2109 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2109  pili assembly chaperone  100 
 
 
214 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0135661  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  88.07 
 
 
243 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  87.65 
 
 
243 aa  421  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  39.44 
 
 
233 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  36.89 
 
 
243 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  36.89 
 
 
243 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  36.89 
 
 
243 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  34.17 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  38.7 
 
 
242 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.93 
 
 
248 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.92 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  32.64 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  35.59 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  36.49 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  30.45 
 
 
253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  31.92 
 
 
250 aa  124  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  34.48 
 
 
252 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  34.1 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  30.43 
 
 
248 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.2 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  47.32 
 
 
246 aa  118  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.74 
 
 
243 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  32.19 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  31.22 
 
 
253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  31.22 
 
 
253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  31.22 
 
 
253 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  33.03 
 
 
240 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  52.08 
 
 
241 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  33.03 
 
 
245 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  27.95 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  29.88 
 
 
256 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  30.92 
 
 
246 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.64 
 
 
243 aa  111  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  30.18 
 
 
282 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2296  gram-negative pilus assembly chaperone  41.04 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2385  gram-negative pilus assembly chaperone  41.04 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.560587  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0023  pili assembly chaperone  34.67 
 
 
227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000753719  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  32.77 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  32.77 
 
 
267 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  32.77 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  30.04 
 
 
251 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  32.77 
 
 
309 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  32.34 
 
 
309 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  34.53 
 
 
226 aa  108  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  28.45 
 
 
241 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.94 
 
 
250 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  40.15 
 
 
224 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  28.9 
 
 
234 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  28.81 
 
 
241 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  30.32 
 
 
224 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.32 
 
 
224 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  30.32 
 
 
224 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  30.32 
 
 
224 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  31.62 
 
 
245 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  32.09 
 
 
257 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  29.32 
 
 
246 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  41.59 
 
 
266 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.59 
 
 
266 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  29.32 
 
 
246 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  29.32 
 
 
246 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  29.32 
 
 
246 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  39.45 
 
 
250 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  38.85 
 
 
231 aa  101  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.6 
 
 
246 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  29.6 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  28.94 
 
 
247 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  29.6 
 
 
245 aa  98.2  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  31.73 
 
 
244 aa  98.2  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  31.73 
 
 
244 aa  98.2  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  31.73 
 
 
272 aa  98.2  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2340  pilus assembly chaperone  41.51 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854509  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2497  gram-negative pilus assembly chaperone  41.51 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  30.05 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2389  pilus assembly chaperone  41.51 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  29.15 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  30.99 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.77 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  35.61 
 
 
246 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.02 
 
 
238 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  35.61 
 
 
246 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  28.86 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  34.67 
 
 
260 aa  94.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.26 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  41.82 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3019  chaperone CupA5  29 
 
 
238 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  27.57 
 
 
245 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  35.14 
 
 
246 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  31.62 
 
 
252 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  28.89 
 
 
225 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  26.22 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  26.98 
 
 
267 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  26.98 
 
 
267 aa  86.3  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0266347 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.35 
 
 
231 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  27.23 
 
 
250 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  29.39 
 
 
234 aa  85.1  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  27.05 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2829  pili assembly chaperone  29.82 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  26.92 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  27.49 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  26.92 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>