282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37000 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  100 
 
 		 237 aa  470  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  61.82 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3019  chaperone CupA5  58.45 
 
 		 238 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  46.46 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  46.46 
 
 		 244 aa  181  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  46.46 
 
 		 244 aa  181  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  40 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  36.41 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  36.41 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  34.75 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0302  pili assembly chaperone  37.23 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  37.33 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.96 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.37 
 
 		 250 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2829  pili assembly chaperone  39.15 
 
 		 314 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  32.74 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.56 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  35.24 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  33.77 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  31.39 
 
 		 241 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0369  fimbrial chaperone protein  37.13 
 
 		 252 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  35.19 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  28.99 
 
 		 253 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  28.99 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  34.72 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.28 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  31.74 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0376  fimbrial chaperone protein  36.71 
 
 		 252 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.187051  normal  0.269695 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  31.3 
 
 		 259 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  34.72 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  31.74 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  28.57 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.84 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0429  fimbrial chaperone protein  36.71 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193885  hitchhiker  0.000207785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  35.87 
 
 		 246 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  40.11 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  31.33 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0367  fimbrial chaperone protein  35.86 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.828681  normal  0.687788 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  39.52 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  34.33 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  34.04 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  34.05 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  34.04 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  35.96 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.33 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  34.04 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  34.04 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  31.06 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  31.06 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  31.14 
 
 		 246 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  31.14 
 
 		 246 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  32.43 
 
 		 253 aa  128  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  33.48 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  32.47 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0389  fimbrial chaperone protein  35.45 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0895943 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  33.62 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.06 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  34.98 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  37.63 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  32.33 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.15 
 
 		 266 aa  124  9e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  31.71 
 
 		 267 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  34.96 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  31.71 
 
 		 267 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  31.3 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  26.85 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  27.85 
 
 		 242 aa  122  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  30.26 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  32.87 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  36.02 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  32.64 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  33.76 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  30.22 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  30.22 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  31.55 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.33 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  30.84 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  28.75 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  28.94 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  29.13 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  28.94 
 
 		 309 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  28.21 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  33.76 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  31.78 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  34.07 
 
 		 260 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  32.24 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  31.78 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  34.1 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  35.27 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  32.24 
 
 		 252 aa  111  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.38 
 
 		 238 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.06 
 
 		 248 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  31.31 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  28.12 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  30.97 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  32.59 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  30.97 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  31.78 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  30.97 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  33.05 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>