279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_4043 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  100 
 
 
243 aa  498  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  100 
 
 
243 aa  498  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  99.59 
 
 
243 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  46.96 
 
 
242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.86 
 
 
248 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  43.93 
 
 
248 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  43.5 
 
 
248 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  43.67 
 
 
252 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  43.72 
 
 
248 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  46.12 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  39.83 
 
 
243 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  39.83 
 
 
243 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  39.13 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  39.13 
 
 
267 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  39.13 
 
 
253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  39.37 
 
 
309 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  38.74 
 
 
309 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.97 
 
 
243 aa  164  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  39.15 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  41.05 
 
 
233 aa  163  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  38.52 
 
 
241 aa  161  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  35.53 
 
 
236 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  34.68 
 
 
234 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  37.28 
 
 
246 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  36.32 
 
 
245 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  38.14 
 
 
246 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  36.32 
 
 
240 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  35.43 
 
 
241 aa  158  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  37.3 
 
 
241 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  36.52 
 
 
247 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  36.48 
 
 
244 aa  155  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  36.48 
 
 
272 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  36.48 
 
 
244 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  35.06 
 
 
245 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  35.29 
 
 
250 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  35.78 
 
 
251 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  38.63 
 
 
246 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  38.63 
 
 
246 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.96 
 
 
250 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  35.65 
 
 
247 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  38.63 
 
 
246 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  38.63 
 
 
246 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.97 
 
 
246 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.68 
 
 
265 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  36.95 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.06 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  36.87 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.21 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.58 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  36.48 
 
 
253 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  34.58 
 
 
266 aa  146  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  36.48 
 
 
253 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  35.14 
 
 
227 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  36.05 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  37.27 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2109  pili assembly chaperone  36.89 
 
 
214 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0135661  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  33.76 
 
 
245 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  33.91 
 
 
245 aa  141  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  37.09 
 
 
250 aa  141  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  31.51 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  32.9 
 
 
259 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2829  pili assembly chaperone  34.85 
 
 
314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  35.83 
 
 
249 aa  135  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  34.47 
 
 
249 aa  134  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  36.92 
 
 
227 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  34.4 
 
 
237 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  39.58 
 
 
231 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  35.37 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  36.92 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  31.11 
 
 
248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.54 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  35.98 
 
 
227 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  35.98 
 
 
227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  35.98 
 
 
227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  37.56 
 
 
224 aa  128  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.56 
 
 
224 aa  129  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  37.56 
 
 
224 aa  129  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  37.56 
 
 
224 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2389  pilus assembly chaperone  33.91 
 
 
226 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2340  pilus assembly chaperone  37.06 
 
 
226 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854509  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  32.89 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  35.9 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2497  gram-negative pilus assembly chaperone  37.56 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  32.77 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  31.58 
 
 
246 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.05 
 
 
248 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.6 
 
 
252 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.23 
 
 
247 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.23 
 
 
247 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  32.17 
 
 
228 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  30.41 
 
 
250 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  32.16 
 
 
226 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  30.14 
 
 
246 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  30.14 
 
 
246 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  27.87 
 
 
260 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  31.42 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  31.65 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
267 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
267 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>