281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2236 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  100 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  43.19 
 
 		 250 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  42.73 
 
 		 241 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  41.3 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  42.4 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.85 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  40.43 
 
 		 246 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  40.43 
 
 		 246 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  40.43 
 
 		 246 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  40.43 
 
 		 246 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  40.71 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  38.33 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  39.45 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.43 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  37.89 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  36.1 
 
 		 249 aa  164  9e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.05 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.62 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.62 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.89 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  43.39 
 
 		 257 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  37.83 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  39.17 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  41.67 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  39.17 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  39.17 
 
 		 240 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  38.71 
 
 		 245 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  36.77 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  34.84 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  37.67 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  34.73 
 
 		 266 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.73 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  35.32 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  35.32 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  35.32 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  31.12 
 
 		 248 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  35.94 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  36.04 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  36.32 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  37.78 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  34.84 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  34.84 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.44 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2296  gram-negative pilus assembly chaperone  34.68 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  36.44 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2385  gram-negative pilus assembly chaperone  34.68 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.560587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  36.44 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  33.2 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  35.37 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  31.76 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0023  pili assembly chaperone  34.96 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000753719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  34.84 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.68 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  36.44 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  34.68 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  34.68 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  34.68 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  34.68 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.88 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  32.74 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  35.96 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  33.76 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  33.76 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  33.76 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  34.39 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  33.8 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  33.33 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  28.76 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  33.47 
 
 		 282 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  35.37 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  31.19 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  33.92 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  35.37 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  33.92 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.63 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  35.37 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  34.6 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  32.56 
 
 		 248 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  31.39 
 
 		 252 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  33.18 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  36.61 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  30.3 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.83 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  38.79 
 
 		 246 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  38.79 
 
 		 246 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  31.16 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  31.16 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  36.05 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  35.71 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  31.74 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  31.74 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.98 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  30.14 
 
 		 248 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  31.74 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  31.74 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  32.58 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  32.33 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  31.86 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  30.7 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  32.13 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>