299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4023 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  54.63 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  47.13 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  55.75 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  47.39 
 
 		 247 aa  228  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  51.53 
 
 		 250 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  48.03 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  50.7 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.78 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  50.22 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  47.09 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  45.81 
 
 		 245 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  45.58 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  45.81 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  43.59 
 
 		 241 aa  195  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  43.67 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  43.67 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  43.67 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  43.67 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  41.28 
 
 		 245 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  41.28 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  41.59 
 
 		 236 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.67 
 
 		 246 aa  191  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  43.26 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  40.69 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  45.7 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  42.13 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.67 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  40.51 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.11 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  41.11 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  43.17 
 
 		 248 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  42.04 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  42.15 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.38 
 
 		 238 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  44.02 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  38.36 
 
 		 253 aa  174  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  38.36 
 
 		 253 aa  174  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  37.93 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  35.32 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  42.57 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.28 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  40.93 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  38.71 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  38.46 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  38.16 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  37.28 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  37.28 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.74 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  37.77 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  35.71 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  40.43 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  32.08 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  34.53 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  34.53 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  37.02 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  37.02 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  37.02 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  37.02 
 
 		 309 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  37.02 
 
 		 309 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  37.71 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  37.71 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  35.34 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.93 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  38.81 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  40.56 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  34.52 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2389  pilus assembly chaperone  43.88 
 
 		 226 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  34.92 
 
 		 267 aa  141  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  34.92 
 
 		 267 aa  141  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  39.78 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  40.56 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  40 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2497  gram-negative pilus assembly chaperone  43.8 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.29 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2340  pilus assembly chaperone  43.8 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  43.48 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.866269 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  44.2 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  44.2 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  44.2 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  44.2 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0023  pili assembly chaperone  45.77 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000753719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  37.97 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  32.77 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  34.88 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  34.63 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  32.77 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  36.96 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  32.77 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  33.33 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  34.6 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  33.33 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  33.33 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  31.91 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  36.19 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  34.6 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  31.91 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  33.33 
 
 		 256 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  34.17 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.12 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>