279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1276 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  100 
 
 
233 aa  480  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  41.6 
 
 
243 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  41.6 
 
 
243 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  42.17 
 
 
243 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  42.17 
 
 
243 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  42.17 
 
 
243 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  37.08 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  37.78 
 
 
248 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2109  pili assembly chaperone  39.57 
 
 
214 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0135661  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  35.09 
 
 
247 aa  154  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  37.1 
 
 
248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.47 
 
 
265 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  36.2 
 
 
248 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.62 
 
 
243 aa  148  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  34.55 
 
 
250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  35 
 
 
242 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.5 
 
 
248 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  34.18 
 
 
246 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  33.06 
 
 
253 aa  142  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  33.06 
 
 
253 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  36.87 
 
 
234 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  32.64 
 
 
253 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  36.05 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  33.33 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.75 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  35.29 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  35.29 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  34.73 
 
 
246 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  34.58 
 
 
247 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  34.73 
 
 
246 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  33.33 
 
 
266 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  33.62 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.65 
 
 
246 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  33.76 
 
 
225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  33.47 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  33.19 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  33.04 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  33.33 
 
 
248 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  33.61 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  31.6 
 
 
251 aa  128  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.49 
 
 
238 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  32.61 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  33.2 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  33.2 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  33.2 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  33.2 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  33.18 
 
 
230 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  33.18 
 
 
230 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  31.17 
 
 
256 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  31.17 
 
 
256 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  33.33 
 
 
230 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  31.17 
 
 
256 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  31.17 
 
 
256 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  33.33 
 
 
230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.06 
 
 
243 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  31.98 
 
 
237 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  32.73 
 
 
230 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  33.33 
 
 
230 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  31.8 
 
 
236 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  33.33 
 
 
230 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.33 
 
 
230 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  33.91 
 
 
237 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
230 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  33.33 
 
 
230 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  31.8 
 
 
240 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  31.8 
 
 
245 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  30.71 
 
 
256 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  30 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  30 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  30 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  32.55 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  32.89 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  30 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  32.55 
 
 
227 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  32.68 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  30 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.39 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  32.55 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  31.8 
 
 
241 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  32.68 
 
 
227 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.49 
 
 
248 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  33.33 
 
 
230 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.88 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  33.95 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  34.39 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  31.36 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  33.94 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  33.94 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  29.07 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  33.94 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  29.13 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.87 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  31 
 
 
248 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  31.54 
 
 
282 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  30.87 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  31.53 
 
 
245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  29.73 
 
 
226 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.14 
 
 
244 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  34.56 
 
 
216 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>