282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4921 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  100 
 
 
229 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  68.24 
 
 
232 aa  328  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  68.24 
 
 
232 aa  327  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  68.24 
 
 
232 aa  327  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  68.24 
 
 
232 aa  327  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  46.9 
 
 
226 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  42.17 
 
 
230 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  42.17 
 
 
230 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  42.17 
 
 
230 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  42.17 
 
 
230 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.24 
 
 
234 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  44.39 
 
 
236 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  44.39 
 
 
236 aa  175  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  41.82 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0023  chaperone protein FimC  46.8 
 
 
275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.20078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  43.84 
 
 
241 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0024  chaperone protein FimC  47 
 
 
228 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0267159  normal  0.211748 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.84 
 
 
241 aa  172  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0024  chaperone protein FimC  47 
 
 
228 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117286  normal  0.0585411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  43.84 
 
 
241 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  43.84 
 
 
241 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0025  chaperone protein FimC  47 
 
 
275 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.263689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  43.38 
 
 
241 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0025  chaperone protein FimC  47 
 
 
275 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.37249  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  45.23 
 
 
216 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.43 
 
 
231 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  40.54 
 
 
230 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  40 
 
 
231 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  40.43 
 
 
231 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  40.43 
 
 
231 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  40.09 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  40.09 
 
 
230 aa  165  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  40.09 
 
 
230 aa  165  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.09 
 
 
230 aa  165  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  40.09 
 
 
230 aa  165  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  40.09 
 
 
230 aa  165  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.7 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  40 
 
 
231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  40 
 
 
231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  36.87 
 
 
228 aa  164  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  40.83 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  39.64 
 
 
230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  39.81 
 
 
225 aa  161  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  36.82 
 
 
234 aa  154  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  39.71 
 
 
230 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  35.17 
 
 
234 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  38.03 
 
 
249 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  40.61 
 
 
256 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  40.61 
 
 
256 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  40.61 
 
 
256 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  40.61 
 
 
256 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.23 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  38.53 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  39.29 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  38.53 
 
 
224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  38.32 
 
 
233 aa  144  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  38.89 
 
 
245 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  38.32 
 
 
233 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  38.32 
 
 
233 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  38.32 
 
 
233 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.32 
 
 
233 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.63 
 
 
238 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  38.32 
 
 
233 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  36.27 
 
 
227 aa  141  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  36.32 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  36.27 
 
 
227 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  35.35 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  35.35 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  35.87 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  35.35 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  37.87 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  35.74 
 
 
241 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  36.32 
 
 
227 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  36.27 
 
 
227 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  35.29 
 
 
227 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  35.15 
 
 
247 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.32 
 
 
248 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  41.81 
 
 
248 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  34.98 
 
 
248 aa  134  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.13 
 
 
247 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.13 
 
 
247 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  33.77 
 
 
236 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  34.45 
 
 
253 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.19 
 
 
243 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  35.71 
 
 
243 aa  132  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  36.64 
 
 
259 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  34.03 
 
 
253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  40.09 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  35.27 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  34.03 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  33.88 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  35.47 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  36.59 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  36.68 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  35.14 
 
 
240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  35.14 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  35.04 
 
 
247 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.63 
 
 
265 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  36.48 
 
 
246 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  37.61 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>