285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3392 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  100 
 
 		 248 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  42.93 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  39.3 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  39.3 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  39.3 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  38.81 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  38.81 
 
 		 227 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  41.35 
 
 		 226 aa  168  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  39.07 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  36.24 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  36.24 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  36.24 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  36.24 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.24 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  36.11 
 
 		 216 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  33.62 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  35.74 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.74 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  33.62 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  35.74 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  35.74 
 
 		 231 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  35.74 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  35.74 
 
 		 231 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  35.53 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  35.71 
 
 		 230 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  34.98 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  35.71 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  35.24 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  35.24 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  35.24 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  34.18 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  33.83 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  34.65 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0337  periplasmic fimbrial chaperone protein  32.34 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963877  normal  0.0114031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.3 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  31.14 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  34.65 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  33.94 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.94 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  33.94 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  33.94 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  33.94 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  33.94 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  28.97 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  28.97 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  33.62 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  34.93 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  28.97 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  30.26 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  33.19 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4669  periplasmic chaperone  32.38 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  34.93 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.93 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.64 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  34.93 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  34.93 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.64 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.64 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  33.03 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.64 
 
 		 232 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  33.48 
 
 		 233 aa  121  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  28.5 
 
 		 227 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  28.04 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  34.21 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.39 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  33.18 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  29.41 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  32.57 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  29.52 
 
 		 244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  31.17 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  31.33 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  34.45 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  32.2 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0330  gram-negative pili assembly chaperone  32.47 
 
 		 201 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0029  fimbrial chaperone  28.96 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.91937  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  30.73 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0029  fimbrial chaperone  28.96 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  0.103429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  29.13 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  30.8 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  33.96 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  30.8 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0024  chaperone protein FimC  35.29 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117286  normal  0.0585411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0024  chaperone protein FimC  35.29 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0267159  normal  0.211748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0023  chaperone protein FimC  35.1 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.20078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  29.47 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  30.14 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0025  chaperone protein FimC  35.29 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.263689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0025  chaperone protein FimC  35.29 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.37249  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  32.24 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  32.24 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  32.24 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  28.28 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  29.31 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0030  fimbrial chaperone  29.67 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8197  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  29.39 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  32.35 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.54 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0030  fimbrial chaperone  28.64 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  32.73 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  29.2 
 
 		 245 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>