279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0029 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0029  fimbrial chaperone  100 
 
 		 243 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.91937  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0029  fimbrial chaperone  97.94 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  0.103429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0030  fimbrial chaperone  99.05 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0030  fimbrial chaperone  98.1 
 
 		 211 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0028  fimbrial chaperone  97.63 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal  0.10634 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2175  putativi pili assembly chaperone  44.04 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.741204 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1059  putativi pili assembly chaperone  40.98 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349289  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00948  predicted periplasmic pilini chaperone  41.74 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00512688  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2699  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.74 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000623101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00955  hypothetical protein  41.74 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00537151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1053  putativi pili assembly chaperone  40.57 
 
 		 245 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000246739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2652  putativi pili assembly chaperone  41.3 
 
 		 236 aa  168  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000294251  hitchhiker  0.00357409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  35.56 
 
 		 225 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  38.36 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  37.02 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  36.54 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  37.5 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  36.54 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  36.06 
 
 		 227 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  35.09 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  35.09 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  35.09 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  35.09 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  32.75 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.09 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  34.25 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  36.7 
 
 		 216 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  34.25 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  34.73 
 
 		 230 aa  125  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  34.25 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  34.25 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  32.6 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  32.6 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.6 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  32.6 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  33.04 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  34.39 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  32.6 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  33.04 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  34.19 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  34.19 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.19 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  34.19 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  33.79 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  34.19 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  34.19 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  34.76 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  34.36 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  33.76 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  35.53 
 
 		 251 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  28.96 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  37.16 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  32.86 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.89 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  32.91 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.85 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  35.24 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.24 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  34.26 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.33 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  33.5 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  33.8 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  33.8 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  33.8 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  33.8 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  33.79 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  32.42 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  32.77 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  31.49 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  31.82 
 
 		 237 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  31.25 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  36.65 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.58 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  32.89 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  32.89 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  32.89 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  32.89 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  30.24 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0839363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  33.19 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  33.19 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  31.05 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  31.34 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  33.19 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  33.19 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  32.2 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  32.91 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.71 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0024  chaperone protein FimC  34.42 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117286  normal  0.0585411 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  35.08 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0025  chaperone protein FimC  34.42 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.37249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  32.57 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0025  chaperone protein FimC  34.42 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.263689  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0024  chaperone protein FimC  34.42 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0267159  normal  0.211748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0023  chaperone protein FimC  33.49 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.20078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  28.44 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  31.16 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  31.16 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.16 
 
 		 231 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  34.55 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  34.51 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>