288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0330 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0330  gram-negative pili assembly chaperone  100 
 
 
201 aa  417  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  98.01 
 
 
245 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0337  periplasmic fimbrial chaperone protein  92.04 
 
 
246 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963877  normal  0.0114031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4669  periplasmic chaperone  50.24 
 
 
276 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2758  pili assembly chaperone  47.71 
 
 
273 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1530  chaperone protein PsaB precursor  47.71 
 
 
273 aa  202  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000277957  normal  0.0151187 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2677  pili assembly chaperone  47.71 
 
 
273 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0736658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  41.84 
 
 
234 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  40.72 
 
 
227 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  41.24 
 
 
227 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  40.21 
 
 
227 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  40.72 
 
 
227 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  39.39 
 
 
225 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  40.21 
 
 
227 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  39.5 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0060  periplasmic pilus chaperone CS3-1  35.86 
 
 
241 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4881  chaperone protein SefB  34.36 
 
 
246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.19486  hitchhiker  0.00460109 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  33.01 
 
 
227 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  32.2 
 
 
227 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  32.52 
 
 
227 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  32.52 
 
 
227 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  32.52 
 
 
227 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.9 
 
 
231 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  35.9 
 
 
231 aa  121  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  35.9 
 
 
231 aa  121  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  35.9 
 
 
231 aa  121  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  35.38 
 
 
231 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  35.38 
 
 
231 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  35.38 
 
 
224 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  32.47 
 
 
248 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  35.64 
 
 
243 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  36.14 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.16 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  34.17 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  35.82 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  31.96 
 
 
232 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  31.96 
 
 
232 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  31.96 
 
 
232 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  31.96 
 
 
232 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  33.33 
 
 
230 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  33.33 
 
 
230 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  33.33 
 
 
230 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  33.33 
 
 
230 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  32.51 
 
 
228 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  33.33 
 
 
237 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  29.19 
 
 
234 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0030  fimbrial chaperone  29.8 
 
 
211 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8197  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  32.18 
 
 
237 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0029  fimbrial chaperone  29.8 
 
 
243 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.91937  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  30.05 
 
 
241 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  30.05 
 
 
241 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  30.05 
 
 
241 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  30.05 
 
 
241 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0030  fimbrial chaperone  29.29 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292301  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.05 
 
 
241 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  30.05 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0029  fimbrial chaperone  29.8 
 
 
245 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  0.103429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0028  fimbrial chaperone  29.29 
 
 
211 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal  0.10634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  30.69 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.73 
 
 
234 aa  98.2  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  28.43 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.75 
 
 
243 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  29.69 
 
 
230 aa  95.9  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  29.74 
 
 
224 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.774785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  29.74 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  28.5 
 
 
236 aa  94  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.74 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  29.74 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  29.74 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  29.74 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  29.74 
 
 
224 aa  94  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  29.67 
 
 
246 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  29.67 
 
 
246 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  29.67 
 
 
246 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  29.67 
 
 
246 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  35.19 
 
 
260 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  32.4 
 
 
229 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  29.23 
 
 
233 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  29.19 
 
 
245 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  27.98 
 
 
236 aa  92  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.423034 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.67 
 
 
246 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  31.4 
 
 
250 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3019  chaperone CupA5  36.13 
 
 
238 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  30.66 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  28.65 
 
 
230 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.65 
 
 
230 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  28.43 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  29.19 
 
 
253 aa  89.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  27.1 
 
 
259 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  28.65 
 
 
230 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  28.65 
 
 
230 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  29.47 
 
 
245 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  28.65 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  28.65 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  31.28 
 
 
253 aa  89  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  27.1 
 
 
245 aa  88.6  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  28.23 
 
 
259 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  28.37 
 
 
240 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.09 
 
 
244 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  28.37 
 
 
245 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>