279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2758 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1530  chaperone protein PsaB precursor  100 
 
 		 273 aa  558  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000277957  normal  0.0151187 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2677  pili assembly chaperone  100 
 
 		 273 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0736658  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2758  pili assembly chaperone  100 
 
 		 273 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4669  periplasmic chaperone  44.74 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  47.37 
 
 		 245 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0337  periplasmic fimbrial chaperone protein  43.13 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963877  normal  0.0114031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0330  gram-negative pili assembly chaperone  47.71 
 
 		 201 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580697  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  37.61 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  37.61 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  37.61 
 
 		 227 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  37.18 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  38.03 
 
 		 227 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  38.27 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  39.91 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  37.89 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0060  periplasmic pilus chaperone CS3-1  36 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  34.62 
 
 		 227 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  34.62 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  34.68 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  34.68 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  34.68 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4881  chaperone protein SefB  32.8 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.19486  hitchhiker  0.00460109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.72 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  32.75 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  32.33 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  35.48 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  32.31 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  35.02 
 
 		 224 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.02 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  35.06 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  35.94 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  35.94 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  35.94 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  31.06 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  35.94 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  32.33 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  30.4 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  31.7 
 
 		 241 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  30.8 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  30.6 
 
 		 237 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0029  fimbrial chaperone  29.89 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.91937  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  33.19 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.65 
 
 		 244 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  27.03 
 
 		 238 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0029  fimbrial chaperone  29.5 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  0.103429 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  28.83 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  33.19 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.36 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  27.45 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  28.17 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  27.45 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0030  fimbrial chaperone  31.44 
 
 		 211 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8197  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  28.17 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.62 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  30.9 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  30.26 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  27.45 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.38 
 
 		 241 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  31.51 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  31.76 
 
 		 243 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  27.06 
 
 		 241 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.91 
 
 		 243 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  27.78 
 
 		 230 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  27.78 
 
 		 230 aa  99  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.78 
 
 		 230 aa  99  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  27.78 
 
 		 230 aa  99  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  27.75 
 
 		 234 aa  99  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  30.38 
 
 		 241 aa  98.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  27.78 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0028  fimbrial chaperone  30.4 
 
 		 211 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal  0.10634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  29.8 
 
 		 251 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  32.22 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  29.6 
 
 		 216 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  30.91 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  30.91 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  29.17 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0030  fimbrial chaperone  30.84 
 
 		 211 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  30.91 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  30.91 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  29.17 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  30.8 
 
 		 227 aa  97.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  28.51 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  28.51 
 
 		 236 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  28.51 
 
 		 245 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  30.43 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  28.79 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  27.38 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  27.8 
 
 		 229 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  31.6 
 
 		 246 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  26.15 
 
 		 275 aa  95.5  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  31.6 
 
 		 246 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  31.6 
 
 		 246 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  30.09 
 
 		 246 aa  95.5  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  30.09 
 
 		 246 aa  95.5  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  31.6 
 
 		 246 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  29.26 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  26.81 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  31.38 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  29 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  29 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>