285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2694 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  99.6 
 
 
253 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  100 
 
 
253 aa  512  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  99.6 
 
 
253 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  46.09 
 
 
236 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  48.39 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  48.39 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  44.92 
 
 
241 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.11 
 
 
244 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  44.49 
 
 
241 aa  201  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.38 
 
 
243 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  44.44 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  43.97 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  42.08 
 
 
247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  44 
 
 
250 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  39.82 
 
 
248 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  41.08 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  41.53 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  41.08 
 
 
246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  41.08 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  41.08 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.14 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.35 
 
 
246 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  38.33 
 
 
247 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.77 
 
 
265 aa  175  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  38.36 
 
 
246 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  41.41 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  40.09 
 
 
234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  41.07 
 
 
250 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  41.13 
 
 
257 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  37.95 
 
 
253 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  36.96 
 
 
248 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.14 
 
 
266 aa  168  7e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  36.14 
 
 
266 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.76 
 
 
243 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  33.06 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  37.82 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  37.39 
 
 
267 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  37.39 
 
 
253 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  37.39 
 
 
267 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.21 
 
 
252 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  37.66 
 
 
309 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  35.42 
 
 
249 aa  159  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  36.4 
 
 
252 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  37.02 
 
 
282 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  34.33 
 
 
252 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  39.04 
 
 
256 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  39.04 
 
 
256 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  39.04 
 
 
256 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  39.04 
 
 
256 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  36.29 
 
 
243 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  35.32 
 
 
233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  33.94 
 
 
248 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  36.29 
 
 
243 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  35.19 
 
 
242 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  32.88 
 
 
248 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  35.43 
 
 
245 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  35.43 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.67 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  32.87 
 
 
248 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  36.48 
 
 
243 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  36.48 
 
 
243 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  36.48 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  34.98 
 
 
259 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  36 
 
 
248 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  38.71 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  35.09 
 
 
227 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  30.8 
 
 
238 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  33.02 
 
 
250 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  35.19 
 
 
228 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  35.08 
 
 
267 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  35.08 
 
 
267 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  35.78 
 
 
232 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  35.5 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  35.5 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  35.5 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  35.1 
 
 
267 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  32.35 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  30.28 
 
 
237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.15 
 
 
266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.88 
 
 
248 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  34.62 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  35.66 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  34.62 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  34.62 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  32.45 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  35.78 
 
 
251 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  35.09 
 
 
248 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  34.62 
 
 
227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  34.2 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  34.03 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1317  fimbral chaperone protein  33.76 
 
 
260 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.27 
 
 
247 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.27 
 
 
247 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  30.9 
 
 
225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  33.47 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  32.14 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  32.13 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1134  pili assembly chaperone  33.04 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  0.162532 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.62 
 
 
224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  33.62 
 
 
224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>