291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4461 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  100 
 
 
224 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  97.32 
 
 
231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  97.32 
 
 
231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  97.32 
 
 
231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  97.32 
 
 
231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  96.88 
 
 
231 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  96.88 
 
 
231 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  42.73 
 
 
228 aa  184  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  40.85 
 
 
232 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  40.85 
 
 
232 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  40.85 
 
 
232 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  40.85 
 
 
232 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  40.83 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  39.37 
 
 
226 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  38.57 
 
 
237 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  36.87 
 
 
225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  38.79 
 
 
241 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  38.79 
 
 
241 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  38.79 
 
 
241 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.79 
 
 
241 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  38.32 
 
 
241 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  38.12 
 
 
230 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  38.12 
 
 
230 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  38.12 
 
 
230 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  38.12 
 
 
230 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  39.05 
 
 
216 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  35.98 
 
 
236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  38.05 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  38.05 
 
 
227 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  37.56 
 
 
227 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  38 
 
 
234 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  35.98 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  38.24 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  37.56 
 
 
227 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  36.67 
 
 
233 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  36.62 
 
 
230 aa  141  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  36.62 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  36.62 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  36.62 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.62 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  36.62 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  36.62 
 
 
230 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  36.2 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  37.73 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.32 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  34.27 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  36.15 
 
 
230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.6 
 
 
234 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  36.07 
 
 
257 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  35.53 
 
 
248 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  35.84 
 
 
247 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.89 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  37.19 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  36.94 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  36.49 
 
 
243 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  34.78 
 
 
249 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  36.94 
 
 
249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  36.02 
 
 
260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  36.49 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  35.96 
 
 
241 aa  128  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  31.3 
 
 
234 aa  128  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0337  periplasmic fimbrial chaperone protein  35.64 
 
 
246 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963877  normal  0.0114031 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  35.53 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  34.31 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  35.53 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  35.53 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  34.31 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  34.31 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  33.75 
 
 
246 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  34.91 
 
 
250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  35.09 
 
 
256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0024  chaperone protein FimC  35.41 
 
 
228 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0267159  normal  0.211748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  36.14 
 
 
245 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0024  chaperone protein FimC  35.41 
 
 
228 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117286  normal  0.0585411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0025  chaperone protein FimC  35.41 
 
 
275 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.263689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0025  chaperone protein FimC  35.41 
 
 
275 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.37249  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0023  chaperone protein FimC  35.27 
 
 
275 aa  124  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.20078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  32.05 
 
 
253 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  32.29 
 
 
227 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.65 
 
 
252 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  33.78 
 
 
241 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  33.33 
 
 
264 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.5 
 
 
238 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  34.58 
 
 
224 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.89 
 
 
265 aa  121  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  33.94 
 
 
247 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  35.19 
 
 
245 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  34.68 
 
 
251 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  35.62 
 
 
246 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  34.65 
 
 
233 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  35.62 
 
 
246 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  34.55 
 
 
237 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  35.62 
 
 
246 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  35.62 
 
 
246 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  33.17 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.31 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  33.17 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0330  gram-negative pili assembly chaperone  35.38 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  35.51 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  33.64 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>