288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5937 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  100 
 
 		 260 aa  533  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  49.57 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  47.09 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  40.69 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  41.49 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  39.06 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  41.67 
 
 		 234 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  43.56 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  42.8 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.29 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  42.13 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.16 
 
 		 265 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  40.35 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  39.42 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  38.17 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  38.17 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  38.17 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  38.17 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.71 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.68 
 
 		 246 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  37.12 
 
 		 245 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  35.34 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  37.11 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  36.36 
 
 		 248 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  34.69 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  36.65 
 
 		 282 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  35.32 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.89 
 
 		 238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.05 
 
 		 244 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  34.48 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  35.43 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.9 
 
 		 243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  34.53 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  34.53 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  33.2 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.85 
 
 		 266 aa  142  8e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  34.15 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  34.62 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.41 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  34.02 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  35.06 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  32.3 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  33.91 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.22 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  32.3 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  35.96 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  35.96 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  35.96 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  36.36 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  30.51 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  31.75 
 
 		 264 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.75 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  32.35 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  34.38 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  32.35 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  32.35 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  33.77 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  35.17 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  35.17 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  35.17 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  35.17 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  32.49 
 
 		 237 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  34.45 
 
 		 248 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  35.54 
 
 		 231 aa  131  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  35.54 
 
 		 231 aa  131  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  33.03 
 
 		 248 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  34.71 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  33.6 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  35.54 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  33.06 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  35.54 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  36.02 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.12 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  33.33 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1317  fimbral chaperone protein  35.14 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  32.79 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1134  pili assembly chaperone  34.25 
 
 		 261 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  0.162532 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  32.84 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  32.84 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  32.84 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  36.48 
 
 		 226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  32.94 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  32.35 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  31.93 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  32.94 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  35.32 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  32.55 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  41.06 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  28.28 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2296  gram-negative pilus assembly chaperone  39.87 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2385  gram-negative pilus assembly chaperone  39.87 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.560587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.8 
 
 		 247 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.8 
 
 		 247 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2389  pilus assembly chaperone  40 
 
 		 226 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2340  pilus assembly chaperone  40 
 
 		 226 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  35.43 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  35.43 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2497  gram-negative pilus assembly chaperone  40 
 
 		 226 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  34.98 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.93 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>