279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0337 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0337  periplasmic fimbrial chaperone protein  100 
 
 		 246 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963877  normal  0.0114031 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  87.4 
 
 		 245 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0330  gram-negative pili assembly chaperone  92.04 
 
 		 201 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4669  periplasmic chaperone  47.3 
 
 		 276 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2758  pili assembly chaperone  43.13 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1530  chaperone protein PsaB precursor  43.13 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000277957  normal  0.0151187 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2677  pili assembly chaperone  43.13 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0736658  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  41.79 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  41.29 
 
 		 227 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  41.79 
 
 		 227 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  41.79 
 
 		 227 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  41.29 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  43.35 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  38.94 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  43.78 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0060  periplasmic pilus chaperone CS3-1  35.04 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4881  chaperone protein SefB  33.33 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.19486  hitchhiker  0.00460109 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  33.01 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  32.21 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  32.54 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  32.54 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  32.54 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.14 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  36.14 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  36.14 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  36.14 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  35.64 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  35.64 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  35.64 
 
 		 224 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  32.34 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  35.38 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  33.96 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  34.5 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.33 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  34.43 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.33 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.33 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  34 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.33 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  34.5 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.5 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.97 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  34.67 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  34.67 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  34.5 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  34.67 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  34.5 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  34.67 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  34.67 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  33.17 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  30.62 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  30.99 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  32.84 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  32.51 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.17 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  30.62 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  32.02 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  31.66 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  30.81 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.81 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  30.81 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  30.81 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  30.81 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  30.81 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0029  fimbrial chaperone  29.76 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.91937  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0030  fimbrial chaperone  29.56 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  30.81 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  30.84 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  30.56 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  30.56 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.59 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  30.56 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0029  fimbrial chaperone  29.76 
 
 		 245 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  0.103429 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  30.56 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  31.19 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  31.19 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  30.69 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.69 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  30.69 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0028  fimbrial chaperone  29.06 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal  0.10634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  36.47 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  30.69 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0030  fimbrial chaperone  29.06 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  30.69 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.56 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  29.28 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  30.3 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  33.8 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  30.2 
 
 		 233 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  32.42 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  31.6 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  28.71 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  31.69 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  31.78 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  30.66 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  30.32 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  32.19 
 
 		 251 aa  95.1  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  28.23 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  28.51 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  28.11 
 
 		 259 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>