289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4918 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  100 
 
 
227 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  99.12 
 
 
227 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  99.12 
 
 
227 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  99.12 
 
 
227 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  98.68 
 
 
227 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  47.12 
 
 
225 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  46.85 
 
 
226 aa  204  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  47.34 
 
 
234 aa  194  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  43.06 
 
 
227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  43.06 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  42.58 
 
 
227 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  42.11 
 
 
227 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  43.35 
 
 
227 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  35.43 
 
 
234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  36.32 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.92 
 
 
234 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  34.88 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  34.88 
 
 
243 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  33.33 
 
 
245 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  37.91 
 
 
228 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0337  periplasmic fimbrial chaperone protein  33.01 
 
 
246 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963877  normal  0.0114031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  32.14 
 
 
234 aa  135  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.39 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  32.39 
 
 
241 aa  132  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  32.39 
 
 
241 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  32.39 
 
 
241 aa  132  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  32.39 
 
 
241 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  34.62 
 
 
243 aa  132  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  32.88 
 
 
232 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1530  chaperone protein PsaB precursor  34.62 
 
 
273 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000277957  normal  0.0151187 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2758  pili assembly chaperone  34.62 
 
 
273 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  31.91 
 
 
246 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2677  pili assembly chaperone  34.62 
 
 
273 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0736658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  34.62 
 
 
253 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.62 
 
 
243 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  35.84 
 
 
237 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  34.62 
 
 
253 aa  131  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  32.88 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  34.03 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  32.56 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  32.88 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  32.7 
 
 
216 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  32.88 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  34.19 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  33.02 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  33.02 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  37.5 
 
 
256 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  37.5 
 
 
256 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  32.63 
 
 
247 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  37.5 
 
 
256 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.31 
 
 
243 aa  128  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  33.02 
 
 
230 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.96 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  37.05 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  32.09 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  33.02 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  32.56 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  33.33 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  33.02 
 
 
237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  32.91 
 
 
241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  33.47 
 
 
241 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0330  gram-negative pili assembly chaperone  33.01 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4669  periplasmic chaperone  34.76 
 
 
276 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.2 
 
 
244 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  32.14 
 
 
230 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1317  fimbral chaperone protein  33.49 
 
 
260 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0029  fimbrial chaperone  33.79 
 
 
243 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.91937  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0029  fimbrial chaperone  33.33 
 
 
245 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  0.103429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  31.7 
 
 
230 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  31.7 
 
 
230 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.7 
 
 
230 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  31.7 
 
 
230 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  33.79 
 
 
227 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  31.7 
 
 
230 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  28.5 
 
 
248 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  33.01 
 
 
238 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  31.67 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  31.86 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  34.43 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  31.25 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  30.05 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.05 
 
 
231 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  29.18 
 
 
251 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  31.05 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  31.05 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  32.8 
 
 
264 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0030  fimbrial chaperone  35.32 
 
 
211 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292301  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0028  fimbrial chaperone  35.32 
 
 
211 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal  0.10634 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  31.05 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  31.05 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  31.98 
 
 
241 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  30.41 
 
 
224 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  31.98 
 
 
240 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  31.98 
 
 
245 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  31.65 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0030  fimbrial chaperone  34.83 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8197  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.54 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  32.11 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  30.8 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.06 
 
 
248 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>