280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0127 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  100 
 
 
245 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  100 
 
 
240 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  99.58 
 
 
236 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  92.54 
 
 
241 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  64.08 
 
 
244 aa  325  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  64.34 
 
 
243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  50 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  49.38 
 
 
247 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  47.3 
 
 
241 aa  221  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  46.06 
 
 
241 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  44.73 
 
 
253 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  44.73 
 
 
253 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  44.73 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  46.94 
 
 
256 aa  211  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  43.16 
 
 
248 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  44.86 
 
 
246 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  44.86 
 
 
246 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  44.86 
 
 
246 aa  205  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  44.86 
 
 
246 aa  205  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  44.63 
 
 
246 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  45.08 
 
 
250 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  44.17 
 
 
265 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  43.75 
 
 
247 aa  198  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  44.17 
 
 
246 aa  198  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  43.72 
 
 
234 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  41.28 
 
 
246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  45.74 
 
 
250 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  44.16 
 
 
282 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  42.86 
 
 
251 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  46.54 
 
 
250 aa  188  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  40.08 
 
 
248 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  44.34 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  40.27 
 
 
253 aa  181  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  39.09 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  43.36 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.09 
 
 
266 aa  178  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  37.23 
 
 
252 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  40.82 
 
 
249 aa  176  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  35.96 
 
 
252 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  40.55 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  38.72 
 
 
259 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  38.72 
 
 
245 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  38.72 
 
 
245 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  39.91 
 
 
248 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  39.63 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  35.34 
 
 
243 aa  161  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  35.34 
 
 
243 aa  161  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.67 
 
 
252 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  36.77 
 
 
250 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  34.91 
 
 
243 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  39.17 
 
 
233 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  36.8 
 
 
267 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  36.8 
 
 
253 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  36.8 
 
 
267 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  36.29 
 
 
309 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  36.8 
 
 
309 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  39.11 
 
 
231 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  37.38 
 
 
246 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.54 
 
 
248 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  34.48 
 
 
260 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  41.07 
 
 
248 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  31.91 
 
 
242 aa  148  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  36.05 
 
 
243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  36.05 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  37.67 
 
 
237 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  37.14 
 
 
249 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.19 
 
 
266 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  36.32 
 
 
226 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0023  pili assembly chaperone  36.16 
 
 
227 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000753719  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.32 
 
 
238 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  37.86 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  37.86 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  37.86 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  37.86 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  35.35 
 
 
227 aa  138  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.48 
 
 
232 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.48 
 
 
232 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  33.62 
 
 
234 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.48 
 
 
232 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.48 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  32.76 
 
 
225 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  34.98 
 
 
238 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  34.35 
 
 
229 aa  135  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  35.66 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  34.72 
 
 
237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  32.91 
 
 
244 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  32.91 
 
 
244 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2829  pili assembly chaperone  34.91 
 
 
314 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  32.91 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2385  gram-negative pilus assembly chaperone  35.89 
 
 
227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.560587  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  32 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2296  gram-negative pilus assembly chaperone  35.89 
 
 
227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  32 
 
 
246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.02 
 
 
248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2389  pilus assembly chaperone  33.19 
 
 
226 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2340  pilus assembly chaperone  34.29 
 
 
226 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854509  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  34.63 
 
 
234 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  33.64 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2497  gram-negative pilus assembly chaperone  34.29 
 
 
226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  35.38 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.866269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>