297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2038 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  100 
 
 		 248 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  74.29 
 
 		 251 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3825  pili assembly chaperone  52.74 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  51.67 
 
 		 259 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  54.08 
 
 		 244 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  53.95 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  37.89 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  34.02 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  40.85 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.81 
 
 		 248 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  35.02 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  36.74 
 
 		 241 aa  141  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  35.29 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  35.19 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  38.32 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  37.21 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.64 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  35.29 
 
 		 247 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  34.43 
 
 		 250 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  33.91 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  33.91 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  33.91 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  33.91 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  36.12 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.95 
 
 		 248 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.91 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  35.11 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  35.07 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  34.06 
 
 		 225 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  35.55 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.31 
 
 		 247 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.31 
 
 		 247 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  35.55 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  36.02 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.16 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  34.6 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.34 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.9 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  34.43 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  33.05 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.33 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  35.22 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  36.79 
 
 		 239 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  32.9 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  32.79 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  30.25 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  32.9 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.18 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  32.47 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  32.35 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  36.02 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  36.02 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  33.64 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  33.19 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  32.44 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  33.96 
 
 		 257 aa  118  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  30.96 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  30.96 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  30.96 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  32.91 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  33.62 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  32.59 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  30.64 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  30.96 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  33.18 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  36.79 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  31.28 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  33.18 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  33.79 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  33.64 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  35.09 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  33.18 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  30.87 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  30.58 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  35.09 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  35.09 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  30.84 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  31.5 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  31.62 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  31.62 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  31.62 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  30.84 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  30.84 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  30.84 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  32.03 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  34.65 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  34.65 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  35.21 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3925  putative fimbrial assembly chaperone FanE  32.31 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.75 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.16 
 
 		 231 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  31.44 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  31.88 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  32.88 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  32.14 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  31.16 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  31.88 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  31.88 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  31.88 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  34.68 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>