284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4722 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  100 
 
 		 252 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  70.54 
 
 		 251 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  62.65 
 
 		 255 aa  304  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0216  chaperone protein PapD  58.41 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000206765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0234  chaperone protein PapD  58.41 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0011245  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0233  chaperone protein PapD  57.96 
 
 		 250 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0218  chaperone protein PapD  57.96 
 
 		 250 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000225767  normal  0.548646 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  58.45 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  58.45 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  57.26 
 
 		 239 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  52.21 
 
 		 257 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  52.21 
 
 		 257 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  52.21 
 
 		 257 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  52.21 
 
 		 257 aa  262  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  51.91 
 
 		 250 aa  258  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  51.91 
 
 		 250 aa  258  7e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  52.05 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  48.4 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  54.46 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  51.91 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  53.42 
 
 		 250 aa  254  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  52.51 
 
 		 241 aa  245  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  54.23 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  52.21 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  48.71 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  48.05 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  44.68 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  47.62 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  43.7 
 
 		 248 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.62 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  45 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.28 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  44.55 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  44.55 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  43.64 
 
 		 263 aa  184  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  41.74 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  41.74 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  41.74 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  41.44 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  41.74 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  41.74 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  41.74 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.32 
 
 		 242 aa  178  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  39.58 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  39.58 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  39.17 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  39.17 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00677  predicted assembly protein  40.18 
 
 		 243 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0743  periplasmic pilus chaperone family protein  41.1 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  38.75 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0634  periplasmic pilus chaperone family protein  41.1 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2938  pili assembly chaperone  40.64 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0765  periplasmic pilus chaperone family protein  40.18 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00666  hypothetical protein  40.55 
 
 		 220 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  36.47 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0807  periplasmic pilus chaperone family protein  39.13 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3223  periplasmic pilus chaperone family protein  36.11 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000604612  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0652  pili assembly chaperone  36.08 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  35.98 
 
 		 249 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.98 
 
 		 249 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  35.98 
 
 		 249 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  36 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  35.71 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  36.55 
 
 		 241 aa  135  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  36.36 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  36.36 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  36.36 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  35.93 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04795  chaperone PapD  34.6 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  33.47 
 
 		 249 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  35.32 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.93 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  36.49 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.59 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  35.16 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  36.74 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  34.44 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  34.29 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.39 
 
 		 234 aa  125  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  34.78 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  37.74 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  37.74 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  34.78 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  34.78 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  34.78 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  36.21 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  36.12 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.93 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  35.14 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  31.46 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  35.75 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  35.14 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.88 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  37.74 
 
 		 227 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  35.91 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  33.89 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  33.89 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  35.29 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  35.29 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  33.89 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>