281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02261 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  100 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  94.4 
 
 		 250 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  86.4 
 
 		 252 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  82 
 
 		 250 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  82 
 
 		 250 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  81.2 
 
 		 250 aa  428  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  90.04 
 
 		 241 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  74 
 
 		 250 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0234  chaperone protein PapD  62.72 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0011245  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0216  chaperone protein PapD  62.72 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000206765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0218  chaperone protein PapD  62.72 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000225767  normal  0.548646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0233  chaperone protein PapD  62.72 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  51.44 
 
 		 251 aa  261  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  52.79 
 
 		 252 aa  257  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  51.48 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  51.48 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  51.48 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  51.48 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  51.87 
 
 		 255 aa  234  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  43.04 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  43.04 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  43.22 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  45.57 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  45.57 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  45.57 
 
 		 242 aa  205  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  43.06 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.75 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  40.6 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  39 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  40.74 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  40.74 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  41.63 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  40.28 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.62 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  39.35 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.5 
 
 		 242 aa  174  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  39.53 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  39.07 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  39.53 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2938  pili assembly chaperone  38.2 
 
 		 243 aa  169  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  39.53 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  39.53 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  39.53 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0765  periplasmic pilus chaperone family protein  37.77 
 
 		 243 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00677  predicted assembly protein  38.63 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0634  periplasmic pilus chaperone family protein  38.2 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0743  periplasmic pilus chaperone family protein  38.2 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0807  periplasmic pilus chaperone family protein  39.13 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  37.07 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00666  hypothetical protein  38.46 
 
 		 220 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  36.64 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  36.64 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  36.64 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  36.64 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  40.64 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.64 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3223  periplasmic pilus chaperone family protein  39.32 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000604612  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  40.64 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0652  pili assembly chaperone  37.5 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  38.89 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04795  chaperone PapD  30.73 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.29 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  36.73 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.34 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  31.05 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  40.59 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  40.21 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  32.47 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  36.73 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.8 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  33.64 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  32.3 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  33.91 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  36.44 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  36.44 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  36.44 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  36.44 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  34.23 
 
 		 245 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  33.48 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  36 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  34.23 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  33.48 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  32.48 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  35.04 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  35.71 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  33.48 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  32.88 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  30.48 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  35.29 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  33.94 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  31.62 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  32.88 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.88 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  32.88 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  32.88 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  32.88 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  35.9 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  33.94 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.94 
 
 		 224 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>