285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2631 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2631  periplasmic pilus chaperone family protein  100 
 
 
241 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  87.5 
 
 
252 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  85.59 
 
 
250 aa  427  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  85.59 
 
 
250 aa  427  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  84.75 
 
 
250 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1320  Pili assembly chaperone, N-terminal  90.04 
 
 
250 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02261  predicted periplasmic pilus chaperone  89.59 
 
 
250 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  75.31 
 
 
250 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02221  hypothetical protein  91.54 
 
 
230 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0233  chaperone protein PapD  63.16 
 
 
250 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.420216  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0216  chaperone protein PapD  63.16 
 
 
250 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000206765  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0218  chaperone protein PapD  63.16 
 
 
250 aa  307  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000225767  normal  0.548646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0234  chaperone protein PapD  63.16 
 
 
250 aa  307  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0011245  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  52.14 
 
 
251 aa  252  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  51.05 
 
 
252 aa  248  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3173  chaperone protein PapD  51.26 
 
 
257 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.315924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3090  chaperone protein PapD  51.26 
 
 
257 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3271  chaperone protein PapD  51.26 
 
 
257 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.685151  normal  0.0204539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3154  chaperone protein PapD  51.26 
 
 
257 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190535 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  51.4 
 
 
255 aa  229  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  45.66 
 
 
239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  45.66 
 
 
239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  45.21 
 
 
239 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  43.8 
 
 
249 aa  204  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  43.8 
 
 
255 aa  204  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  43.8 
 
 
242 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4674  pili assembly chaperone  43.78 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.07 
 
 
249 aa  185  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  38.03 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.61 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  38.43 
 
 
248 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  37.96 
 
 
263 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  38.43 
 
 
263 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1058  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.73 
 
 
249 aa  167  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  38.46 
 
 
248 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  37.04 
 
 
248 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2919  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.66 
 
 
242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.264872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2938  pili assembly chaperone  36.48 
 
 
243 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0765  periplasmic pilus chaperone family protein  36.05 
 
 
243 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00677  predicted assembly protein  36.48 
 
 
243 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0743  periplasmic pilus chaperone family protein  36.48 
 
 
243 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0634  periplasmic pilus chaperone family protein  36.48 
 
 
243 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0807  periplasmic pilus chaperone family protein  39.81 
 
 
243 aa  158  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  37.67 
 
 
246 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  37.21 
 
 
249 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  37.67 
 
 
249 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  37.67 
 
 
249 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  37.67 
 
 
249 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  37.67 
 
 
249 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  38.63 
 
 
247 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  37.76 
 
 
247 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  37.76 
 
 
247 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  38.82 
 
 
247 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  38.82 
 
 
247 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3223  periplasmic pilus chaperone family protein  37.5 
 
 
249 aa  151  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000604612  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0652  pili assembly chaperone  37.5 
 
 
249 aa  151  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  36.51 
 
 
249 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  37.08 
 
 
249 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  37.08 
 
 
249 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.08 
 
 
249 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00666  hypothetical protein  37.04 
 
 
220 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04795  chaperone PapD  32.3 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.73 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  36.76 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  41.76 
 
 
250 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  40.96 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  39 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.31 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  38.89 
 
 
259 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  32.74 
 
 
229 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  36.17 
 
 
241 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  35.79 
 
 
247 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  36.41 
 
 
248 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  38.98 
 
 
225 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  36.52 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  33.91 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  32.9 
 
 
251 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  35.98 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  33.04 
 
 
227 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  34.23 
 
 
240 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  34.23 
 
 
245 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3825  pili assembly chaperone  31.65 
 
 
245 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  29.13 
 
 
249 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  33.04 
 
 
227 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  33.04 
 
 
243 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  35.27 
 
 
234 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  32.59 
 
 
227 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  37.57 
 
 
246 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  37.02 
 
 
246 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  37.57 
 
 
246 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  37.57 
 
 
246 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  37.57 
 
 
246 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  31.76 
 
 
249 aa  105  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  33.33 
 
 
233 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  33.92 
 
 
224 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  33.48 
 
 
224 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  36.02 
 
 
246 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  37.7 
 
 
253 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  37.7 
 
 
253 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  33.04 
 
 
243 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>