290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1666 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  100 
 
 
252 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  50.84 
 
 
252 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  41.7 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  41.01 
 
 
248 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  46.12 
 
 
243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  46.12 
 
 
243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  40.83 
 
 
248 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  46.12 
 
 
243 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  37.45 
 
 
242 aa  175  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.91 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  37 
 
 
236 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  38.32 
 
 
240 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  38.32 
 
 
245 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  37.38 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  34.45 
 
 
245 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  35.37 
 
 
256 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  38.87 
 
 
253 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  38.87 
 
 
267 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  38.87 
 
 
309 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  40 
 
 
267 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  38.87 
 
 
309 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.71 
 
 
250 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  34.33 
 
 
253 aa  155  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  35.62 
 
 
234 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  34.33 
 
 
253 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  33.91 
 
 
253 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  37.61 
 
 
257 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.91 
 
 
244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  36.21 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  36.21 
 
 
243 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  36.68 
 
 
231 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  32.08 
 
 
246 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  35.6 
 
 
250 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  33.94 
 
 
251 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  33.61 
 
 
246 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  40.7 
 
 
282 aa  141  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  31.44 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.05 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  31.74 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  35.87 
 
 
247 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  38.59 
 
 
250 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.68 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  33.2 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  36.02 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  33.2 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  32.14 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  34.68 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  33.19 
 
 
246 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  35.18 
 
 
266 aa  136  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  33.19 
 
 
246 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.2 
 
 
246 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  32.49 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.03 
 
 
265 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  30.64 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  34.42 
 
 
233 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.32 
 
 
243 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  31.34 
 
 
233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  36.51 
 
 
244 aa  129  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  36.51 
 
 
244 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  36.51 
 
 
272 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  31.09 
 
 
246 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.21 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  35.07 
 
 
245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  34.67 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  35.07 
 
 
245 aa  125  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  34.6 
 
 
259 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  32 
 
 
267 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  32 
 
 
267 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2109  pili assembly chaperone  34.48 
 
 
214 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0135661  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  29.17 
 
 
259 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.63 
 
 
248 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  31.25 
 
 
256 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  31.25 
 
 
256 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  31.25 
 
 
256 aa  121  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  31.25 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  31.6 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  32.88 
 
 
238 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2340  pilus assembly chaperone  34.68 
 
 
226 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854509  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  30.09 
 
 
250 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0023  pili assembly chaperone  31.62 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000753719  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  31.8 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2389  pilus assembly chaperone  34.1 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2497  gram-negative pilus assembly chaperone  34.1 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  38.12 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  32.57 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.84 
 
 
252 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  32.33 
 
 
245 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  31.36 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.19 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.19 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2385  gram-negative pilus assembly chaperone  32.9 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.560587  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2296  gram-negative pilus assembly chaperone  32.9 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  29.91 
 
 
227 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.84 
 
 
266 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  32.09 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.91 
 
 
224 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  33.91 
 
 
224 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  33.91 
 
 
224 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  33.91 
 
 
224 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2829  pili assembly chaperone  31.07 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>