276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0167 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  100 
 
 
248 aa  507  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  48.5 
 
 
242 aa  221  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  42.86 
 
 
243 aa  205  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  42.86 
 
 
243 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  42.86 
 
 
243 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  40.74 
 
 
248 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  42.99 
 
 
252 aa  184  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  38.74 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  36.91 
 
 
252 aa  171  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  34.68 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  39.74 
 
 
243 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  39.74 
 
 
243 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.35 
 
 
244 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  33.48 
 
 
241 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  31.74 
 
 
246 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.59 
 
 
243 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  34.03 
 
 
245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  35.68 
 
 
309 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  35.27 
 
 
267 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  32.13 
 
 
240 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  35.27 
 
 
267 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  31.62 
 
 
236 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  35.27 
 
 
253 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.05 
 
 
243 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  35.27 
 
 
309 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  32.13 
 
 
245 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  33.04 
 
 
247 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.25 
 
 
265 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  33.76 
 
 
246 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  31.65 
 
 
251 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  30.29 
 
 
266 aa  139  6e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.99 
 
 
266 aa  138  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  36.07 
 
 
244 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  36.07 
 
 
272 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  36.07 
 
 
244 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  34.36 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  32.29 
 
 
248 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  34.22 
 
 
241 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  32.57 
 
 
233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  31.38 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  29.07 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  30.88 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  30.88 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  31.22 
 
 
253 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  30.41 
 
 
253 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  32.38 
 
 
249 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  31.49 
 
 
246 aa  131  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  31.49 
 
 
246 aa  131  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  34.84 
 
 
231 aa  131  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  31.49 
 
 
246 aa  131  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  31.49 
 
 
246 aa  131  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.41 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2109  pili assembly chaperone  34.93 
 
 
214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0135661  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  30.04 
 
 
256 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.06 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  32.72 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  33.04 
 
 
250 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  34.53 
 
 
246 aa  128  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  34.53 
 
 
246 aa  128  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  32.47 
 
 
241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  32.6 
 
 
259 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  32.16 
 
 
245 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  32.16 
 
 
245 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  31.94 
 
 
257 aa  121  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  29.13 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  32.77 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  28.81 
 
 
237 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  39.13 
 
 
233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2829  pili assembly chaperone  30.84 
 
 
314 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  32.35 
 
 
267 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  32.35 
 
 
267 aa  115  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  27.54 
 
 
248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  29.39 
 
 
227 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  28.76 
 
 
228 aa  113  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  28.33 
 
 
260 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  28.27 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  27.92 
 
 
238 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.51 
 
 
234 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  26.38 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.47 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  29.41 
 
 
246 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  25 
 
 
256 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3019  chaperone CupA5  29.24 
 
 
238 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  30.41 
 
 
224 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  27.47 
 
 
229 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.31 
 
 
252 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.14 
 
 
224 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  32.14 
 
 
224 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  24.6 
 
 
256 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  28.51 
 
 
248 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  24.6 
 
 
256 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  32.14 
 
 
224 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  24.6 
 
 
256 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  32.35 
 
 
241 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  29.54 
 
 
230 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  31.76 
 
 
241 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.76 
 
 
241 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  30.87 
 
 
230 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  31.76 
 
 
241 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  29.11 
 
 
230 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0318933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>