276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2832 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  100 
 
 		 252 aa  524  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  50.84 
 
 		 252 aa  263  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  44.1 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  45.28 
 
 		 248 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  45.33 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  43.67 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  43.67 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  43.87 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.99 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  39.13 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  35.68 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  37.92 
 
 		 243 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  36.99 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  37.5 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  36.07 
 
 		 245 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  36.07 
 
 		 240 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  37.24 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  36.6 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  36.6 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  36.6 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  36.6 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  36.4 
 
 		 253 aa  158  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  36.4 
 
 		 253 aa  158  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  35.56 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  35.98 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  37.96 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  36.99 
 
 		 234 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.93 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  37.77 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  38.34 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.39 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.68 
 
 		 250 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  34.98 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  37.1 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  33.19 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  39.91 
 
 		 250 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.27 
 
 		 243 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  33.78 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  35.54 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  31.88 
 
 		 241 aa  141  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  38.26 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.68 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2109  pili assembly chaperone  34.17 
 
 		 214 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0135661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.48 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.48 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  33.75 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  32.75 
 
 		 241 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  33.91 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  33.91 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  34.36 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  34.36 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  36.28 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  33.48 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2829  pili assembly chaperone  34.25 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  32.74 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  35.56 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  34.4 
 
 		 238 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  31.51 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.59 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  34.41 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  34.41 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  34.41 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  32.79 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  34.31 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  31.74 
 
 		 231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  30.33 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.55 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  34.58 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3019  chaperone CupA5  36.2 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  32.24 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  32.24 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  31.56 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  34.11 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  31.67 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  33.33 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  31.56 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  31.11 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.64 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  32.92 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  33.04 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  29.37 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.17 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  31.67 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.95 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.95 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  28.05 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.77 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  32.03 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  29.66 
 
 		 228 aa  111  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  33.06 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  33.06 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  33.03 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  31.6 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  33.06 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  29.26 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  32.91 
 
 		 226 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  32.64 
 
 		 227 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.62 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.63 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  31.06 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>