277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2273 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  99.59 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2109  pili assembly chaperone  88.07 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0135661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  41.67 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  39.83 
 
 		 243 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  39.83 
 
 		 243 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  39.83 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  37.92 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  41.3 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.74 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  40.54 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  40.09 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  36.82 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.84 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  38.25 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  36.29 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  36.21 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  36.29 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  36.29 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  36.74 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  34.53 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.29 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.2 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  33.33 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  33.61 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  36.05 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  33.91 
 
 		 248 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  37.16 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  37.44 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  37.16 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  32.33 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  34.76 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  33.63 
 
 		 282 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.19 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  33.93 
 
 		 224 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  34.14 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  32.64 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  32.23 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  38.43 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  33.93 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  35.86 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.93 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  33.93 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  35.86 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  35.51 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  33.93 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  35.86 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  35.44 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  33.91 
 
 		 245 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  35.59 
 
 		 309 aa  131  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  33.48 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.64 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  35.34 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.19 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0023  pili assembly chaperone  35.93 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000753719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.13 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.79 
 
 		 238 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  31.45 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  33.06 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  31.45 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  36.13 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  31.45 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  31.45 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.73 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  31.05 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2296  gram-negative pilus assembly chaperone  34.48 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2385  gram-negative pilus assembly chaperone  34.48 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.560587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  31.78 
 
 		 247 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  32.16 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  34.1 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  32.16 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  35.1 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  35.1 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  35.1 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  31.72 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  30.87 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  32.7 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  30.87 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  30.87 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  32.7 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  30.87 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  30.09 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.8 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.03 
 
 		 266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  31.58 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  31.38 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  31.38 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  30.8 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  29.13 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  30.8 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  30.96 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  30.16 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  36.67 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  29.66 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  30.86 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  30.16 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2340  pilus assembly chaperone  36.5 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2497  gram-negative pilus assembly chaperone  36.5 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2389  pilus assembly chaperone  36.5 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  30.73 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>