275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2389 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2389  pilus assembly chaperone  100 
 
 		 226 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2340  pilus assembly chaperone  98.67 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2497  gram-negative pilus assembly chaperone  98.23 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  57.59 
 
 		 224 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  57.59 
 
 		 224 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  57.59 
 
 		 224 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  57.59 
 
 		 224 aa  270  9e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2385  gram-negative pilus assembly chaperone  55.95 
 
 		 227 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.560587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2296  gram-negative pilus assembly chaperone  55.95 
 
 		 227 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  55.8 
 
 		 224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0023  pili assembly chaperone  52.68 
 
 		 227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000753719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  38.33 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.93 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  43.88 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  33.05 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  32.35 
 
 		 282 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  38.5 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  36.54 
 
 		 266 aa  135  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  36.71 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.58 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  36.71 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  44.72 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  38.89 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  34.07 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.38 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  33.91 
 
 		 243 aa  128  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.86 
 
 		 244 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  33.91 
 
 		 243 aa  128  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  42.45 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  36.07 
 
 		 250 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  33.64 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  30.49 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  33.64 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  34.35 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  32.35 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  35.06 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  33.01 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  44.88 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  38.03 
 
 		 248 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  33.03 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  31.16 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  40 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  42.47 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.69 
 
 		 250 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  42.18 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  41.89 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  42.18 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  41.89 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.01 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.5 
 
 		 246 aa  118  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  32.38 
 
 		 253 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  32.38 
 
 		 267 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  32.38 
 
 		 309 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  32.38 
 
 		 267 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  34.1 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  30.74 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  32.23 
 
 		 309 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  30.74 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  36.88 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  32.06 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.74 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  42.55 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  33.33 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  33.33 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  33.33 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  30.3 
 
 		 259 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  31.11 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  44.35 
 
 		 248 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  39.13 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  36.5 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  36.5 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  32.03 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  36.96 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  31.6 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  31.6 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  36.84 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  36.99 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  36 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  36.99 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  36.99 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  30.3 
 
 		 252 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  33.95 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  31.08 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.17 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  32.89 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  34.08 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  32.54 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  32.54 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  34.45 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  34.45 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  32.54 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  30.15 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  30.88 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.54 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  31.95 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  32.54 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  32.54 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  30.09 
 
 		 256 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  30.56 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  30.09 
 
 		 256 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>