275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1679 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  100 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  98.88 
 
 
267 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  98.88 
 
 
267 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  37.45 
 
 
247 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  38.11 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  36.17 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.34 
 
 
265 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  37.39 
 
 
250 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  35.43 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  35.57 
 
 
247 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.9 
 
 
243 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  37.65 
 
 
246 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  37.5 
 
 
245 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.5 
 
 
250 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  36.93 
 
 
241 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  34.89 
 
 
272 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  34.89 
 
 
244 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  34.89 
 
 
244 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  34.52 
 
 
246 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  35.71 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  35.71 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  35.71 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  35.71 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  36.67 
 
 
245 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  36.18 
 
 
248 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  35.15 
 
 
245 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  35.15 
 
 
259 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.32 
 
 
246 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.73 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  35.44 
 
 
241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  35.1 
 
 
253 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  35.1 
 
 
253 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.88 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  34.69 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.47 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  36.24 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  33.47 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  34.08 
 
 
233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  32.76 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  29.96 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  36.05 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  34.2 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  36.63 
 
 
225 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  33.33 
 
 
236 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  34.66 
 
 
242 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  34.05 
 
 
245 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  33.47 
 
 
256 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  34.21 
 
 
240 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  32.55 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  33.47 
 
 
256 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  33.47 
 
 
256 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  35.79 
 
 
249 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  36.1 
 
 
226 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  31.09 
 
 
229 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  33.2 
 
 
256 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  30.89 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  35.84 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  31.6 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
243 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
243 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  34.15 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  34.15 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  34.15 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.77 
 
 
248 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  34.3 
 
 
227 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.74 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  30.93 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  32.74 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  32.91 
 
 
231 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  33.88 
 
 
239 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  33.9 
 
 
309 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.61 
 
 
248 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  33.88 
 
 
239 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  33.33 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  36.59 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  34.63 
 
 
227 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  33.33 
 
 
237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  33.33 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  34.2 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  36.1 
 
 
229 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  34.02 
 
 
239 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  34.2 
 
 
227 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.34 
 
 
248 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  34.2 
 
 
227 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  30.74 
 
 
264 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  36.1 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  32.92 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  30.42 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  33.75 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  32.77 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.38 
 
 
249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  30.42 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  35.12 
 
 
224 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  32.23 
 
 
224 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  34.2 
 
 
227 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.6 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  38.6 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  36.87 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  38.6 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>