274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1695 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1695  periplasmic pilus chaperone family protein  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  99.33 
 
 		 236 aa  306  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  98.66 
 
 		 236 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  61.74 
 
 		 241 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  61.74 
 
 		 241 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  61.74 
 
 		 241 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  61.74 
 
 		 216 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  61.74 
 
 		 241 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  61.74 
 
 		 241 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  58.45 
 
 		 234 aa  176  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  50 
 
 		 230 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  50 
 
 		 230 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  50 
 
 		 230 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  50 
 
 		 230 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  49.32 
 
 		 237 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  50.72 
 
 		 230 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  47.14 
 
 		 230 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  47.14 
 
 		 230 aa  135  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  47.14 
 
 		 230 aa  136  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  47.14 
 
 		 230 aa  135  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  47.14 
 
 		 230 aa  135  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  47.14 
 
 		 230 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0024  chaperone protein FimC  47.18 
 
 		 228 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117286  normal  0.0585411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0024  chaperone protein FimC  47.18 
 
 		 228 aa  135  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0267159  normal  0.211748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0025  chaperone protein FimC  47.18 
 
 		 275 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.263689  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  47.14 
 
 		 230 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0025  chaperone protein FimC  47.18 
 
 		 275 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.37249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0023  chaperone protein FimC  47.18 
 
 		 275 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.20078 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  47.14 
 
 		 230 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  42.34 
 
 		 225 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  44.29 
 
 		 229 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  38.51 
 
 		 241 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  36.24 
 
 		 243 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  39.19 
 
 		 227 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  39.19 
 
 		 227 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  42.25 
 
 		 233 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.25 
 
 		 233 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  42.25 
 
 		 233 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  42.25 
 
 		 233 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  41.55 
 
 		 233 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  38.51 
 
 		 227 aa  105  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  39.19 
 
 		 227 aa  105  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  39.19 
 
 		 227 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  41.55 
 
 		 233 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.38 
 
 		 238 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  41.55 
 
 		 224 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  41.55 
 
 		 224 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  35.57 
 
 		 243 aa  104  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  40 
 
 		 256 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  40 
 
 		 256 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  40 
 
 		 256 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  40 
 
 		 256 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  34.9 
 
 		 243 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  38.93 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  38.93 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  38.93 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  37.33 
 
 		 245 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  34.46 
 
 		 241 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  37.23 
 
 		 228 aa  98.2  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  38.26 
 
 		 232 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  38.73 
 
 		 226 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  39.74 
 
 		 237 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.66 
 
 		 243 aa  94  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  37.09 
 
 		 247 aa  93.6  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  40 
 
 		 256 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  33.99 
 
 		 246 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  33.99 
 
 		 246 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  33.99 
 
 		 246 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  33.99 
 
 		 246 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.51 
 
 		 231 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.58 
 
 		 247 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.58 
 
 		 247 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  34.51 
 
 		 224 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  33.8 
 
 		 234 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  34.51 
 
 		 231 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  37.41 
 
 		 227 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.71 
 
 		 265 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  37.75 
 
 		 249 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  30.67 
 
 		 248 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  39.1 
 
 		 252 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.67 
 
 		 243 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.58 
 
 		 248 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  34.51 
 
 		 231 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  34.51 
 
 		 231 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  30.99 
 
 		 227 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  31.69 
 
 		 227 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.33 
 
 		 246 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  36.36 
 
 		 238 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  31.69 
 
 		 227 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  31.69 
 
 		 227 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  35.29 
 
 		 234 aa  87  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  33.8 
 
 		 231 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  35.57 
 
 		 247 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  35.57 
 
 		 247 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  33.8 
 
 		 231 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  35.57 
 
 		 247 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  31.69 
 
 		 227 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  35.57 
 
 		 247 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  34.64 
 
 		 246 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  33.56 
 
 		 248 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>