245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2407 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2407  putative periplasmic chaperone protein  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1678  putative periplasmic chaperone protein  50.47 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6325  putative periplasmic chaperone protein  51.67 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.997215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1754  putative periplasmic chaperone protein  51.67 
 
 		 245 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1132  pili assembly chaperone  48.43 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4895  putative periplasmic chaperone protein  42.53 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4981  putative periplasmic chaperone protein  42.47 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4929  putative periplasmic chaperone protein  42.01 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4477  pili assembly chaperone  41.91 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287547  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0492  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.33 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3869  putative periplasmic chaperone protein  29.31 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1632  putative periplasmic chaperone protein  28.63 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0992283  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0671  putative periplasmic chaperone protein  29.31 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00513818  normal  0.436881 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0164  putative periplasmic chaperone protein  28.63 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3781  putative periplasmic chaperone protein  29.31 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  30.84 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.96 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  31.71 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  29.61 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  29.61 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  29.61 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  30 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.32 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  29.94 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  28.57 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  28.57 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  28.57 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.01 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  28.49 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  29.19 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  29.01 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  27.7 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3197  pili assembly chaperone protein  27.7 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  29.71 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  27.09 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3246  pili assembly chaperone protein  27.7 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3260  pili assembly chaperone protein  28.5 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3362  pili assembly chaperone protein  28.5 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0478294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  30.23 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  31.35 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2829  pili assembly chaperone  31.22 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  27.5 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  27.33 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  27.5 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  27.33 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  27.33 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  27.42 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  28.4 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  27.35 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  25.7 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  27.33 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  27 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  27.5 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  24.35 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  27.5 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.4 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  25.6 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  25.13 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.32 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  30.41 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.67 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  31.33 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  30.67 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0337  periplasmic fimbrial chaperone protein  31.33 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.963877  normal  0.0114031 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  26.14 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  26.14 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  26.14 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  27.33 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0330  gram-negative pili assembly chaperone  30.2 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.580697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  27.68 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.59 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  26.22 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  26.59 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  26.59 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  26.59 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.95 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1530  chaperone protein PsaB precursor  27.33 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000277957  normal  0.0151187 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2758  pili assembly chaperone  27.33 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  30 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  28.28 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2677  pili assembly chaperone  27.33 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0736658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1134  pili assembly chaperone  29.74 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  0.162532 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  25.79 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.99 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  25.79 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  24.84 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0029  fimbrial chaperone  27.53 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.91937  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  28.73 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  27.83 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  29.71 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  26.37 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  26.37 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3019  chaperone CupA5  29.45 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  26.37 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  26.37 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  25.73 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  26.73 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  29.24 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  23.32 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>