73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6325 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1754  putative periplasmic chaperone protein  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6325  putative periplasmic chaperone protein  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.997215  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1678  putative periplasmic chaperone protein  79.65 
 
 		 245 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2407  putative periplasmic chaperone protein  50.42 
 
 		 234 aa  195  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1132  pili assembly chaperone  46.46 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4477  pili assembly chaperone  41.64 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4929  putative periplasmic chaperone protein  39.05 
 
 		 235 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4895  putative periplasmic chaperone protein  39.05 
 
 		 235 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0492  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.38 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4981  putative periplasmic chaperone protein  39.05 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1632  putative periplasmic chaperone protein  31.02 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0992283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0164  putative periplasmic chaperone protein  31.02 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3869  putative periplasmic chaperone protein  29.22 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0671  putative periplasmic chaperone protein  29.22 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00513818  normal  0.436881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3781  putative periplasmic chaperone protein  29.09 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.64 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  26.79 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  23.67 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  25.81 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  25.16 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  25.81 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  25.16 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  25.81 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  29.81 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  29.81 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  27.35 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  27.72 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  25.15 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  26.86 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  25.61 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  25.15 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  25.15 
 
 		 231 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  25.15 
 
 		 231 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  29.86 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  28.57 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  25.15 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  25.15 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  26.99 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.17 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  28.37 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  25.99 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  24.55 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0023  pili assembly chaperone  27.86 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000753719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  26.67 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  26.06 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  26.06 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  26.06 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  24.68 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.42 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2246  pilus assembly chaperone  25.3 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0470931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1547  Pili assembly chaperone, N-terminal  25.3 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.416561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1537  pili assembly chaperone  25.3 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2400  pilus assembly chaperone  25.3 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  30.92 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  25.45 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  23.31 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  25.57 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  29.51 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  25.57 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.68 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  26.21 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  25.47 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  25.57 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  23.81 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3093  gram-negative pilus assembly chaperone  23.49 
 
 		 224 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.866269 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0060  periplasmic pilus chaperone CS3-1  24.14 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  24.1 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  26.8 
 
 		 253 aa  42  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  31.03 
 
 		 253 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  26.8 
 
 		 253 aa  42  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  26.8 
 
 		 253 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  21.16 
 
 		 237 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  24.29 
 
 		 248 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>