83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1678 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1678  putative periplasmic chaperone protein  100 
 
 		 245 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1754  putative periplasmic chaperone protein  79.65 
 
 		 245 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6325  putative periplasmic chaperone protein  79.65 
 
 		 245 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.997215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2407  putative periplasmic chaperone protein  50.68 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1132  pili assembly chaperone  48.42 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4477  pili assembly chaperone  43.04 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4929  putative periplasmic chaperone protein  40.85 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4895  putative periplasmic chaperone protein  40.85 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4981  putative periplasmic chaperone protein  40.38 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0492  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.86 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0164  putative periplasmic chaperone protein  29.36 
 
 		 232 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1632  putative periplasmic chaperone protein  29.36 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0992283  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0671  putative periplasmic chaperone protein  28.1 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00513818  normal  0.436881 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3869  putative periplasmic chaperone protein  28.1 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3781  putative periplasmic chaperone protein  28.1 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  31.61 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  26.5 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.5 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  26.5 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  26.5 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  26.5 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  27.62 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  23.58 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  26 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  26.29 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  24.68 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  27.5 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  26.88 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  27.5 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  27.5 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  29.95 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  27.18 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.18 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  26.88 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  25.33 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  25.82 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  27.38 
 
 		 227 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  29.38 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  26.79 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  26.79 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  26.79 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0060  periplasmic pilus chaperone CS3-1  27.4 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.19 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0824  Pili assembly chaperone, N-terminal  23.68 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  26.76 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  24.67 
 
 		 227 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  28.21 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  25 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  24.09 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  25.84 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  24.09 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  26.26 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  23.77 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  26.8 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  24.09 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  22.83 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  25.47 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  25.66 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  25.47 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  25.47 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  23.08 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  25.3 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  26.09 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  25.41 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  29.44 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  22.35 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  28.14 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3510  periplasmic pilus chaperone family protein  25.6 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  24.55 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  27.38 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  27.38 
 
 		 230 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  27.38 
 
 		 230 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  24.29 
 
 		 243 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  30.67 
 
 		 253 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  27.38 
 
 		 230 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  25.97 
 
 		 250 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02867  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.386418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0653  Pili assembly chaperone, N-terminal  25 
 
 		 249 aa  42  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02917  predicted periplasmic pilin chaperone  25 
 
 		 249 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  27.38 
 
 		 237 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2677  pili assembly chaperone  27.71 
 
 		 273 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0736658  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2758  pili assembly chaperone  27.71 
 
 		 273 aa  42  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1530  chaperone protein PsaB precursor  27.71 
 
 		 273 aa  42  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000277957  normal  0.0151187 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>