40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0164 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1632  putative periplasmic chaperone protein  100 
 
 
236 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0992283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0164  putative periplasmic chaperone protein  100 
 
 
232 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3781  putative periplasmic chaperone protein  45.28 
 
 
230 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0671  putative periplasmic chaperone protein  45.28 
 
 
247 aa  204  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00513818  normal  0.436881 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3869  putative periplasmic chaperone protein  45.28 
 
 
247 aa  204  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0492  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.6 
 
 
224 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1132  pili assembly chaperone  30.84 
 
 
237 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6325  putative periplasmic chaperone protein  31.31 
 
 
245 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.997215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1754  putative periplasmic chaperone protein  31.31 
 
 
245 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4895  putative periplasmic chaperone protein  29.82 
 
 
235 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4929  putative periplasmic chaperone protein  29.36 
 
 
235 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4981  putative periplasmic chaperone protein  29.36 
 
 
235 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1678  putative periplasmic chaperone protein  29.36 
 
 
245 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4477  pili assembly chaperone  31.35 
 
 
282 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287547  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2407  putative periplasmic chaperone protein  28.63 
 
 
234 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2495  fimbrial chaperone protein  32.63 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0727302  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3479  chaperone protein PapD  24.89 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  22.95 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  24.55 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2716  fimbrial chaperone protein  24.1 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.435606  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2488  periplasmic pilus chaperone family protein  34.57 
 
 
250 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1316  pili assembly chaperone  34.57 
 
 
250 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  25.54 
 
 
255 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  23.93 
 
 
248 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  25.97 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  21.58 
 
 
255 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  25.13 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.08 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  25.81 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  27.08 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  23.44 
 
 
260 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  21.86 
 
 
252 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1134  pili assembly chaperone  28.36 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  0.162532 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3183  chaperone protein PapD  27.68 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  23.08 
 
 
250 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  26.88 
 
 
250 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  22.46 
 
 
231 aa  42.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  22.46 
 
 
231 aa  42.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  36.99 
 
 
242 aa  42  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  24.18 
 
 
248 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>