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for query gene Smed_5703 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5703  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  100 
 
 
433 aa  844    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2206  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  49.76 
 
 
432 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.735161  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0207  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  52.69 
 
 
431 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.6438  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4136  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  54.44 
 
 
431 aa  378  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0269529  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3834  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  42.27 
 
 
426 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563327  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5945  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  41.27 
 
 
428 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3745  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.53 
 
 
425 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283661  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3946  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.73 
 
 
422 aa  266  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3966  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  35.32 
 
 
464 aa  266  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352958  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4717  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.58 
 
 
429 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.860355  normal  0.0255819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68290  C4-dicarboxylate transporter  39.23 
 
 
427 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1375  hypothetical protein  38.52 
 
 
427 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3445  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  41.2 
 
 
427 aa  263  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0983264 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3317  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  40.81 
 
 
427 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00194447  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3686  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.73 
 
 
468 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.125762 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0756  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  38.55 
 
 
424 aa  259  6e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.498353  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0719  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  37.28 
 
 
419 aa  259  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1731  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  39.47 
 
 
427 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0197639  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0772  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.16 
 
 
426 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0702  TRAP dicarboxylate transporter, permease component  34.92 
 
 
621 aa  257  4e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000972925  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2121  C4-dicarboxylate transport system permease, large subunit  36.96 
 
 
427 aa  256  5e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.306053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5908  C4-dicarboxylate transporter  38.98 
 
 
427 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.75076  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2749  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  37.74 
 
 
428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000000698233  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3956  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.92 
 
 
425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4820  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34 
 
 
468 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0198908  normal  0.914376 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0270  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.15 
 
 
425 aa  253  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1550  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  37.11 
 
 
427 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.251016  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4093  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.26 
 
 
425 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0543  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.83 
 
 
426 aa  250  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5095  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  41.93 
 
 
429 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1517  C4-dicarboxylate transport protein  36.98 
 
 
453 aa  249  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0331  trap dicarboxylate transporter- dctm subunit  35.25 
 
 
430 aa  249  9e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4770  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.22 
 
 
468 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0799135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3900  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.16 
 
 
424 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004048  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system large permease component  36.61 
 
 
453 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3052  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.17 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669713  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0620  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.22 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.447582  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2978  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  38.33 
 
 
426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.735249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3136  C4-dicarboxylate transport protein  34.66 
 
 
465 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4880  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  43.27 
 
 
430 aa  244  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2753  TRAP dicarboxylate transporter  40.15 
 
 
429 aa  243  6e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.580382  normal  0.0302374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1822  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.98 
 
 
460 aa  242  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00945671  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3212  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  36.77 
 
 
430 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1074  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  38.65 
 
 
426 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2787  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.18 
 
 
459 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0045  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.29 
 
 
424 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0784  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.5 
 
 
464 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1939  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.44 
 
 
425 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0392462  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2481  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36 
 
 
425 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1742  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.73 
 
 
425 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0342  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.81 
 
 
430 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0521  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.94 
 
 
428 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.409753  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2661  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.89 
 
 
462 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4297  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.29 
 
 
426 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1574  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.05 
 
 
459 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0662  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  38.99 
 
 
426 aa  237  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1414  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.89 
 
 
465 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.70486  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3868  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  37.91 
 
 
433 aa  237  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.759388  normal  0.423135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1361  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.89 
 
 
465 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.605043  normal  0.0327101 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0609  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.88 
 
 
427 aa  236  6e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.562631  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0595  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.88 
 
 
427 aa  236  6e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000619396  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2808  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.11 
 
 
465 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2826  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.11 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.922037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2951  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.11 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0943549  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2445  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.47 
 
 
424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1550  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.11 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0883981  normal  0.362308 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3874  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.95 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.102168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1426  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.67 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0870097  normal  0.820962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2211  C4-dicarboxylate transport protein  36.47 
 
 
466 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0445  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  39.53 
 
 
427 aa  234  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000085422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4703  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.57 
 
 
425 aa  234  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3706  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.14 
 
 
419 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2409  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.24 
 
 
426 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.112427 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2449  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.27 
 
 
425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0269  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  36.17 
 
 
435 aa  233  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2863  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.68 
 
 
428 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201465  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2136  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.98 
 
 
426 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.486862  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0484  TRAP dicarboxylate family transporter DctM subunit  36.98 
 
 
426 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.424428  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3266  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.76 
 
 
427 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341254  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1595  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.81 
 
 
430 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2502  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  34.67 
 
 
465 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3456  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.51 
 
 
426 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3105  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  33.18 
 
 
429 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257739  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2518  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.03 
 
 
424 aa  230  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4628  C4-dicarboxylate transporter  39.42 
 
 
427 aa  230  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15180  putative transporter  38.9 
 
 
426 aa  230  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373658  hitchhiker  0.00000309479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52810  C4-dicarboxylate transporter  39.66 
 
 
427 aa  230  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2401  TRAP transporter, DctM subunit  35.42 
 
 
430 aa  229  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000128119  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2498  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.42 
 
 
430 aa  229  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.768752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0859  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.49 
 
 
425 aa  229  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.322805 
 
 
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NC_012791  Vapar_3297  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.16 
 
 
425 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0515873  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2782  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  37.41 
 
 
432 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0479747  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2137  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  40.57 
 
 
427 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_007778  RPB_3327  TRAP dicarboxylate transporter DctM subunit  36.1 
 
 
430 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.868747  normal  0.343483 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1335  putative transporter  38.12 
 
 
426 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_1523  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  35.37 
 
 
429 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.112561  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_0448  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  37.63 
 
 
425 aa  227  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_1112  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  36.87 
 
 
427 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.192986 
 
 
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NC_007948  Bpro_0090  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  36.96 
 
 
446 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008687  Pden_3482  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  38.94 
 
 
427 aa  227  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.157838  normal  0.654271 
 
 
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