88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3399 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1090    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  47.05 
 
 		 538 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  37.81 
 
 		 487 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  29.03 
 
 		 508 aa  179  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  29.01 
 
 		 504 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  30.4 
 
 		 483 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  27.14 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  28.18 
 
 		 476 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  27.54 
 
 		 489 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  28.75 
 
 		 504 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  26.22 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  30.71 
 
 		 482 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  25.9 
 
 		 492 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  25.81 
 
 		 486 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  28.42 
 
 		 525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  24.55 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  26.57 
 
 		 481 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  25.95 
 
 		 518 aa  123  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  27.27 
 
 		 514 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  25.54 
 
 		 505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  25.27 
 
 		 500 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  25.48 
 
 		 546 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  26.69 
 
 		 524 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  26.12 
 
 		 520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  26.02 
 
 		 510 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  25.4 
 
 		 509 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  24.84 
 
 		 547 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  26.84 
 
 		 513 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  27.26 
 
 		 508 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  27.04 
 
 		 479 aa  114  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  27.56 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  25.36 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  27.14 
 
 		 536 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  25.44 
 
 		 506 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  26.14 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  27.54 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  27.37 
 
 		 515 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  24.78 
 
 		 526 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  24.7 
 
 		 529 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  25.96 
 
 		 540 aa  103  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  24.37 
 
 		 498 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  26.05 
 
 		 489 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  25.29 
 
 		 482 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  26.35 
 
 		 533 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  24.86 
 
 		 488 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  24.07 
 
 		 499 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  25.13 
 
 		 533 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  24.57 
 
 		 532 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  24.47 
 
 		 487 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  24.55 
 
 		 488 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  24.33 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  24.07 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  28.23 
 
 		 534 aa  84  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  22.49 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  25.16 
 
 		 541 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  22.78 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  23.34 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  25.47 
 
 		 515 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  26.96 
 
 		 525 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  24 
 
 		 536 aa  80.9  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  25.53 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  23.57 
 
 		 532 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  24.07 
 
 		 541 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  25.13 
 
 		 532 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  23.36 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  25.1 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  24.36 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  25 
 
 		 534 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  23.4 
 
 		 543 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  25.23 
 
 		 552 aa  68.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  25.71 
 
 		 530 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  26.87 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  22.8 
 
 		 526 aa  67  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  25.18 
 
 		 570 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.44 
 
 		 478 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  23.4 
 
 		 578 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  25.89 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  21.37 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  24.53 
 
 		 472 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  25.66 
 
 		 476 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  28 
 
 		 630 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1260  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 685 aa  48.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296024  normal  0.398588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  29.73 
 
 		 576 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  27 
 
 		 476 aa  47  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 576 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 596 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  24.23 
 
 		 493 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 601 aa  45.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>