84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2625 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  1008    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  45.61 
 
 
483 aa  361  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  37.47 
 
 
476 aa  289  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  36.71 
 
 
474 aa  269  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  35.81 
 
 
508 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  36.69 
 
 
504 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  33.26 
 
 
481 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  33.13 
 
 
482 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  31.03 
 
 
489 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  31.06 
 
 
479 aa  195  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  31 
 
 
525 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  28.98 
 
 
500 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  29.51 
 
 
515 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  30.36 
 
 
515 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  29.82 
 
 
504 aa  186  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  30.83 
 
 
488 aa  186  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  29.34 
 
 
505 aa  186  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  28.84 
 
 
547 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  28.99 
 
 
511 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  29.09 
 
 
488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  30.02 
 
 
486 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  30.17 
 
 
489 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  29.25 
 
 
546 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  27.43 
 
 
536 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  30.83 
 
 
498 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  30.73 
 
 
518 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  28.73 
 
 
526 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  28.82 
 
 
509 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  28.29 
 
 
482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  27.92 
 
 
510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  26.88 
 
 
533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  28.21 
 
 
480 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  28.89 
 
 
508 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  29.82 
 
 
487 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  27.13 
 
 
513 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  27.03 
 
 
540 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  28.71 
 
 
525 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  28.54 
 
 
479 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  30.38 
 
 
510 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  27.73 
 
 
487 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  30.13 
 
 
532 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  26.63 
 
 
514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  28.49 
 
 
506 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  27.5 
 
 
533 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  26.15 
 
 
528 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  28.19 
 
 
543 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  25.69 
 
 
522 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  27.12 
 
 
520 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  27.76 
 
 
498 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  26.54 
 
 
514 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  26.19 
 
 
529 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  25.9 
 
 
531 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  27.59 
 
 
524 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  26.67 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  25.95 
 
 
499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  26.55 
 
 
532 aa  126  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  26.49 
 
 
526 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  27.17 
 
 
530 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  27.22 
 
 
541 aa  123  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  25.61 
 
 
528 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  26.56 
 
 
500 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  28.43 
 
 
538 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  24.52 
 
 
492 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  25 
 
 
552 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25.23 
 
 
536 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  25.77 
 
 
532 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  26.68 
 
 
534 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  24.85 
 
 
446 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  27.27 
 
 
570 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  24.49 
 
 
463 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  27.52 
 
 
525 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  26.31 
 
 
478 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  24.69 
 
 
474 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  27.05 
 
 
484 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  25.39 
 
 
578 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  25.71 
 
 
473 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  27.13 
 
 
541 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  24.95 
 
 
472 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  24.81 
 
 
534 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  23.47 
 
 
539 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  27.8 
 
 
630 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  27.1 
 
 
476 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  23.87 
 
 
481 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  25.85 
 
 
476 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>