83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2452 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  79.62 
 
 		 520 aa  870    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1079    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  52.39 
 
 		 511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  47.73 
 
 		 525 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  38.17 
 
 		 504 aa  336  5.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  41.6 
 
 		 528 aa  327  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  39.96 
 
 		 510 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  38.89 
 
 		 513 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  38.58 
 
 		 510 aa  301  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  38.1 
 
 		 514 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  39.4 
 
 		 540 aa  293  5e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  36.1 
 
 		 506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  33.27 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  36.57 
 
 		 498 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  34.23 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  34.21 
 
 		 505 aa  246  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  33.89 
 
 		 533 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  34.13 
 
 		 529 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  32.87 
 
 		 481 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  32.01 
 
 		 476 aa  190  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  29.24 
 
 		 498 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  30.66 
 
 		 482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  29.36 
 
 		 517 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  28.82 
 
 		 528 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  28.34 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  30.33 
 
 		 483 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  28.08 
 
 		 474 aa  167  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  28.6 
 
 		 508 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  28.86 
 
 		 488 aa  160  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  27.05 
 
 		 486 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  27.14 
 
 		 526 aa  156  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  28.32 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  27.53 
 
 		 547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  30.75 
 
 		 541 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  28.5 
 
 		 525 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  30.7 
 
 		 552 aa  146  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  28.12 
 
 		 487 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  28.47 
 
 		 492 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  26.05 
 
 		 532 aa  143  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  26.79 
 
 		 489 aa  140  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  27.03 
 
 		 482 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  28.49 
 
 		 479 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  27.13 
 
 		 504 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  26.55 
 
 		 480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  26.64 
 
 		 522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  28.26 
 
 		 526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  27 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  27.54 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  27.01 
 
 		 630 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  28.36 
 
 		 489 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  27.27 
 
 		 479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  26.88 
 
 		 515 aa  126  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  27.26 
 
 		 538 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  26.06 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  27.7 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  26.12 
 
 		 546 aa  120  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  27.15 
 
 		 543 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  23.84 
 
 		 536 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  24.86 
 
 		 525 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  25.37 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  26.06 
 
 		 530 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  23.9 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  29.43 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  25.88 
 
 		 541 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  27.25 
 
 		 500 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  23.6 
 
 		 518 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  26.13 
 
 		 532 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  24.82 
 
 		 570 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  25.18 
 
 		 534 aa  87  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  22.57 
 
 		 534 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  24.06 
 
 		 484 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  23.99 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.19 
 
 		 492 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  25.1 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  25.09 
 
 		 532 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  24.34 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  24.73 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.46 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  26.05 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  24.89 
 
 		 578 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  23.81 
 
 		 474 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  24.07 
 
 		 472 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  25.44 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>