78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3366 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  100 
 
 
533 aa  1100    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  50.74 
 
 
536 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  29.56 
 
 
514 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  27.02 
 
 
492 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  30.19 
 
 
483 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  29.65 
 
 
474 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  26.44 
 
 
489 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  27.89 
 
 
476 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  26.65 
 
 
486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  25 
 
 
509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  26.1 
 
 
505 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  26.16 
 
 
526 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  25.71 
 
 
528 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  26.47 
 
 
508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  26.12 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  25.28 
 
 
504 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  28.6 
 
 
517 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  25.32 
 
 
508 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  27.62 
 
 
530 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  27.63 
 
 
489 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  26.69 
 
 
525 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  24.95 
 
 
510 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  26.16 
 
 
487 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  26.33 
 
 
525 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  25.6 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  26.48 
 
 
514 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  25.59 
 
 
480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  26.39 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  25.68 
 
 
522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  26.25 
 
 
488 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  26.61 
 
 
541 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  25.41 
 
 
532 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  22.83 
 
 
498 aa  114  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  24.91 
 
 
513 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  24.91 
 
 
515 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  25.76 
 
 
518 aa  110  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  25.86 
 
 
482 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  25.13 
 
 
547 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  24.73 
 
 
511 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  25.71 
 
 
525 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  24.78 
 
 
526 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  24.07 
 
 
552 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  26.02 
 
 
482 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  25.71 
 
 
506 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  23.12 
 
 
540 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  23.97 
 
 
524 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  26.5 
 
 
531 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  27.72 
 
 
510 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  26.54 
 
 
546 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  25.65 
 
 
479 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  25.67 
 
 
500 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  23.45 
 
 
529 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  25.91 
 
 
481 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  25.56 
 
 
498 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  26.33 
 
 
504 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  23.84 
 
 
500 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  26.4 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  29.83 
 
 
520 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  25.38 
 
 
488 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  23.61 
 
 
533 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  24.91 
 
 
528 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  25.99 
 
 
570 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  25.6 
 
 
499 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25.41 
 
 
536 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  31.2 
 
 
630 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  24.17 
 
 
538 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  23.2 
 
 
463 aa  77  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  25.23 
 
 
532 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  27.91 
 
 
481 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  21.08 
 
 
484 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  21.56 
 
 
478 aa  54.3  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  23.66 
 
 
578 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  24.39 
 
 
532 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  27.46 
 
 
534 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  22.01 
 
 
492 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  23.08 
 
 
476 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  26.7 
 
 
472 aa  47  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  24.62 
 
 
476 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>