84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4800 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  1026    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  35.21 
 
 
525 aa  238  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  31.8 
 
 
504 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  32.33 
 
 
510 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  31.44 
 
 
509 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  31.23 
 
 
540 aa  200  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  29.71 
 
 
505 aa  200  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  31.63 
 
 
511 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  30.48 
 
 
529 aa  193  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  30.86 
 
 
481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  32.16 
 
 
514 aa  190  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  29.36 
 
 
520 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  30.59 
 
 
533 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  29.12 
 
 
508 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  28.81 
 
 
524 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  30 
 
 
508 aa  183  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  30.09 
 
 
510 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  30.04 
 
 
506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  32.37 
 
 
482 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  28.6 
 
 
486 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  30.83 
 
 
492 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  30.83 
 
 
474 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  29.82 
 
 
513 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  31.03 
 
 
528 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  28.85 
 
 
488 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  29.56 
 
 
488 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  30.68 
 
 
480 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  30.36 
 
 
483 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  27.11 
 
 
541 aa  156  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  29.61 
 
 
489 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  27.9 
 
 
514 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  28.9 
 
 
525 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  28.74 
 
 
498 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  29.04 
 
 
482 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  28.54 
 
 
517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  29.63 
 
 
479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  28.38 
 
 
476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  27.86 
 
 
500 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  26.97 
 
 
526 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  26.26 
 
 
543 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  28.89 
 
 
487 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  29.48 
 
 
479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  28.23 
 
 
552 aa  141  3e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  27.17 
 
 
528 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  27.65 
 
 
515 aa  136  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  26.45 
 
 
526 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  24.86 
 
 
536 aa  129  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  27.96 
 
 
546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  28.03 
 
 
515 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  25.24 
 
 
499 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  29.05 
 
 
530 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  27.19 
 
 
547 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  27.75 
 
 
504 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  26.01 
 
 
489 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  27.12 
 
 
487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  26.07 
 
 
522 aa  120  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  26.69 
 
 
525 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  26.3 
 
 
541 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  23.61 
 
 
532 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  25.23 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  22.44 
 
 
533 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  25.44 
 
 
538 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  25.87 
 
 
532 aa  106  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  29.3 
 
 
570 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  24.24 
 
 
532 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  25.47 
 
 
534 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  24.37 
 
 
531 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  24.95 
 
 
500 aa  101  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  28.95 
 
 
463 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  27.36 
 
 
484 aa  94  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  28.07 
 
 
534 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25.3 
 
 
536 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  26.11 
 
 
492 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  25.42 
 
 
578 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  25.71 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  44.09 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  23.75 
 
 
472 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  24.58 
 
 
481 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  24.9 
 
 
473 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  37.5 
 
 
446 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  28.57 
 
 
476 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  26.69 
 
 
630 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  21.41 
 
 
478 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1356  extracellular solute-binding protein family 5  23.36 
 
 
596 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>