84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0340 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  986    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  42.62 
 
 		 486 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  34.41 
 
 		 474 aa  229  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  33.2 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  31.56 
 
 		 488 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  32.64 
 
 		 481 aa  203  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  32.45 
 
 		 479 aa  202  9e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  31.3 
 
 		 488 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  29.98 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  30.29 
 
 		 483 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  30.91 
 
 		 515 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  30.81 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  28.57 
 
 		 508 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  30.68 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  28.21 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  28.16 
 
 		 505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  26.35 
 
 		 509 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  29.38 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  28.01 
 
 		 479 aa  144  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  26.76 
 
 		 526 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  26.31 
 
 		 511 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  26.45 
 
 		 504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  27.13 
 
 		 540 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  28.05 
 
 		 528 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  27.31 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  26.69 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  27.6 
 
 		 504 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  26.37 
 
 		 510 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  28.09 
 
 		 487 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  27.15 
 
 		 498 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  26.05 
 
 		 513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  27.85 
 
 		 487 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  25.67 
 
 		 500 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  28.22 
 
 		 525 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  26.46 
 
 		 514 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  27.97 
 
 		 517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  26.64 
 
 		 528 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  27.76 
 
 		 499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  27.1 
 
 		 520 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  26.08 
 
 		 525 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  25.33 
 
 		 536 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  27.17 
 
 		 482 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  26.95 
 
 		 522 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  26.55 
 
 		 524 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  25.42 
 
 		 541 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  27.1 
 
 		 532 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  25 
 
 		 508 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  25.14 
 
 		 518 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  25.74 
 
 		 500 aa  114  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  25.62 
 
 		 533 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  25.38 
 
 		 506 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  25.47 
 
 		 546 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  24.14 
 
 		 529 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  24.68 
 
 		 533 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  25.33 
 
 		 526 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  25.44 
 
 		 484 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  25.36 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  28.85 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  26.72 
 
 		 547 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  25 
 
 		 463 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  23.81 
 
 		 536 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  26.52 
 
 		 530 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  25.74 
 
 		 510 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  26.71 
 
 		 534 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.26 
 
 		 492 aa  90.1  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  25.62 
 
 		 552 aa  89.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  23.35 
 
 		 532 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  25.3 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  23.36 
 
 		 531 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  26.26 
 
 		 570 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  23.96 
 
 		 538 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  23.53 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  24.86 
 
 		 532 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  35.11 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  30.87 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  24.73 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  21.35 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  23.8 
 
 		 473 aa  67  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  25.19 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  25.19 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  22.04 
 
 		 525 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  26.36 
 
 		 630 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  23.89 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  22.51 
 
 		 539 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>