82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1388 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  100 
 
 
552 aa  1143    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  35.87 
 
 
543 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  34.37 
 
 
530 aa  250  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  32.37 
 
 
526 aa  245  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  33.63 
 
 
525 aa  236  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  33.75 
 
 
514 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  32.62 
 
 
541 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  32.33 
 
 
517 aa  216  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  30.6 
 
 
525 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  35.1 
 
 
528 aa  199  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  30.84 
 
 
526 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  28.42 
 
 
532 aa  164  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  28.33 
 
 
525 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  29.15 
 
 
504 aa  157  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  27.59 
 
 
505 aa  153  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  30.14 
 
 
513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  28.23 
 
 
498 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  30.7 
 
 
524 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  28.57 
 
 
540 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  26.81 
 
 
506 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  28.74 
 
 
514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  29.98 
 
 
511 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  26.19 
 
 
510 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  29.98 
 
 
520 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  26.48 
 
 
528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  30.25 
 
 
509 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  28.57 
 
 
489 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  29.75 
 
 
508 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  27.94 
 
 
483 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  25.13 
 
 
482 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  29.56 
 
 
474 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  27.29 
 
 
529 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  27.38 
 
 
510 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  26.6 
 
 
515 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  26.96 
 
 
479 aa  117  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  27.52 
 
 
533 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  29.03 
 
 
488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  26.46 
 
 
522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  28.34 
 
 
498 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  26.31 
 
 
489 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  25.17 
 
 
508 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  25 
 
 
492 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  26.65 
 
 
486 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  26.03 
 
 
533 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  25.09 
 
 
488 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  27.03 
 
 
487 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  25.3 
 
 
476 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  24.43 
 
 
547 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  26.77 
 
 
500 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  27.43 
 
 
482 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  24.91 
 
 
463 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  27.17 
 
 
487 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  26.57 
 
 
481 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  22.6 
 
 
536 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  25.04 
 
 
546 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  25.62 
 
 
480 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  27.81 
 
 
479 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  26.04 
 
 
515 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  26.1 
 
 
500 aa  80.1  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  26.88 
 
 
499 aa  80.1  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  25.55 
 
 
492 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  26.84 
 
 
541 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  25.93 
 
 
538 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  24.23 
 
 
504 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  24.15 
 
 
518 aa  73.6  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  24.19 
 
 
446 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  24.8 
 
 
484 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  38.1 
 
 
630 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  24.68 
 
 
473 aa  70.5  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  24.68 
 
 
532 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  25.23 
 
 
531 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  24.71 
 
 
534 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  23.93 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  23.98 
 
 
534 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  22.95 
 
 
532 aa  60.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  22.42 
 
 
570 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  30.33 
 
 
536 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  27.04 
 
 
472 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  23.23 
 
 
481 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  23.74 
 
 
474 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  24.63 
 
 
476 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  22.74 
 
 
578 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>