83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6877 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  915    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  33.12 
 
 		 463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  29.8 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  28.17 
 
 		 478 aa  152  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  29.34 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  28.17 
 
 		 482 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  27.7 
 
 		 473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  28.87 
 
 		 482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  26.47 
 
 		 472 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  27.73 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  27.35 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  27.58 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  26.6 
 
 		 476 aa  123  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  27.36 
 
 		 492 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  27.48 
 
 		 474 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  27.55 
 
 		 476 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  27.79 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  28.19 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  29.83 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  26.18 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  28.4 
 
 		 528 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  27.17 
 
 		 506 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  28.61 
 
 		 525 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  24.43 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  26.97 
 
 		 488 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  25.93 
 
 		 500 aa  103  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  27.13 
 
 		 504 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  30 
 
 		 480 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  26.1 
 
 		 484 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  26.81 
 
 		 489 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  25.72 
 
 		 510 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  25.94 
 
 		 540 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  25.34 
 
 		 532 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  27.61 
 
 		 536 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  23.11 
 
 		 543 aa  99.8  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  26.97 
 
 		 505 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  25.88 
 
 		 526 aa  97.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  26.96 
 
 		 488 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  25.38 
 
 		 510 aa  96.3  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  24.23 
 
 		 508 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  25.38 
 
 		 509 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  24.18 
 
 		 515 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  23.49 
 
 		 481 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  28.36 
 
 		 479 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  28.42 
 
 		 514 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  24.02 
 
 		 531 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  25.43 
 
 		 513 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  24.85 
 
 		 498 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  25.37 
 
 		 486 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  24.9 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  23.96 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  24.1 
 
 		 536 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  23.29 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  25.97 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  23.05 
 
 		 539 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  27.47 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  26.35 
 
 		 578 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  23.14 
 
 		 518 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  22.83 
 
 		 515 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  24.88 
 
 		 552 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  23.96 
 
 		 570 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  25.86 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  24.31 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  29.83 
 
 		 525 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  26.16 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  23.94 
 
 		 532 aa  70.1  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  25.31 
 
 		 526 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  24.93 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  35.09 
 
 		 529 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  24.43 
 
 		 546 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  32.93 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  22.15 
 
 		 530 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  22.94 
 
 		 532 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  23.95 
 
 		 547 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  23.51 
 
 		 541 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  21.69 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  21.14 
 
 		 541 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  31.3 
 
 		 533 aa  56.6  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  27.23 
 
 		 517 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  27.86 
 
 		 538 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  26.36 
 
 		 528 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  21.66 
 
 		 533 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  21.15 
 
 		 534 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>