82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1104 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  1022    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  47.32 
 
 
510 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  46.49 
 
 
513 aa  428  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  45.65 
 
 
508 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  45.6 
 
 
514 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  40.45 
 
 
528 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  36.69 
 
 
540 aa  280  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  36.47 
 
 
504 aa  275  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  35.86 
 
 
533 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  35.02 
 
 
525 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  35.55 
 
 
520 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  35.81 
 
 
524 aa  247  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  34.09 
 
 
510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  34.6 
 
 
506 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  33.08 
 
 
511 aa  229  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  32.29 
 
 
509 aa  226  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  31.65 
 
 
505 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  32.3 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  33.83 
 
 
529 aa  190  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  32.8 
 
 
482 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  29.34 
 
 
508 aa  166  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  27.24 
 
 
486 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  29.89 
 
 
526 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  29.02 
 
 
476 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  31.41 
 
 
474 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  28.57 
 
 
514 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  28.63 
 
 
522 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  28.74 
 
 
498 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  31.01 
 
 
487 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  32.18 
 
 
483 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  31.53 
 
 
504 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  28.43 
 
 
500 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  27.76 
 
 
492 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  28.76 
 
 
517 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  27.59 
 
 
479 aa  140  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  28.41 
 
 
488 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  27.15 
 
 
480 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  29.36 
 
 
547 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  26.22 
 
 
528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  27.79 
 
 
546 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  28.65 
 
 
488 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  29.07 
 
 
525 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  28.39 
 
 
487 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  27.31 
 
 
518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  27.81 
 
 
543 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  26.89 
 
 
489 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  27.86 
 
 
489 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  26.01 
 
 
499 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  26.84 
 
 
515 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  28.17 
 
 
532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  27.75 
 
 
482 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  25.05 
 
 
526 aa  116  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  26.49 
 
 
532 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  27.23 
 
 
515 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  28.34 
 
 
552 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  27.56 
 
 
531 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  25.94 
 
 
536 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  26.58 
 
 
479 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  28.57 
 
 
538 aa  106  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  27.27 
 
 
541 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  26.3 
 
 
536 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  27.85 
 
 
500 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  28.54 
 
 
525 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  25.66 
 
 
533 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  28.93 
 
 
474 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  26.33 
 
 
530 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  26.59 
 
 
534 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  27.57 
 
 
532 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  26.23 
 
 
463 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  25.45 
 
 
541 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  24.86 
 
 
473 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  25.42 
 
 
534 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  25.24 
 
 
478 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  23.37 
 
 
484 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  22.42 
 
 
630 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  24.18 
 
 
446 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  31.3 
 
 
570 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  24.48 
 
 
492 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  29.03 
 
 
481 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  23.04 
 
 
578 aa  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  24 
 
 
476 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  25.37 
 
 
476 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>