84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0571 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  100 
 
 
522 aa  1071    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  55.53 
 
 
500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  53.55 
 
 
518 aa  555  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  30.78 
 
 
474 aa  196  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  29.57 
 
 
508 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  31.3 
 
 
489 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  30.2 
 
 
483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  27.85 
 
 
476 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  29.13 
 
 
504 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  28.7 
 
 
511 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  30 
 
 
482 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  32.51 
 
 
481 aa  173  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  28.52 
 
 
479 aa  171  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  30.11 
 
 
525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  29.55 
 
 
546 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  30.3 
 
 
504 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  27.36 
 
 
528 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  29.45 
 
 
509 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  25.71 
 
 
515 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  28.2 
 
 
506 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  28.63 
 
 
498 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  27.68 
 
 
540 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  28.31 
 
 
529 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  27.47 
 
 
547 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  28.49 
 
 
505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  27.89 
 
 
510 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  27.67 
 
 
514 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  27.74 
 
 
508 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  28.65 
 
 
486 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  25.69 
 
 
492 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  27.56 
 
 
513 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  25.74 
 
 
515 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  28.89 
 
 
489 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  28.4 
 
 
526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  28.65 
 
 
525 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  26.86 
 
 
487 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  27.92 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  25.97 
 
 
510 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  30.45 
 
 
543 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  29.8 
 
 
517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  24.55 
 
 
531 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  27.45 
 
 
499 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  26.64 
 
 
524 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  27.16 
 
 
514 aa  124  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  28.22 
 
 
532 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  24.36 
 
 
488 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  26.81 
 
 
536 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  25.86 
 
 
479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  24.54 
 
 
482 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  26.95 
 
 
480 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  26.07 
 
 
498 aa  120  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  27.06 
 
 
533 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  26.96 
 
 
532 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  23.6 
 
 
488 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  26.36 
 
 
487 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  26.51 
 
 
528 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  26.46 
 
 
552 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  27.34 
 
 
536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  26.51 
 
 
526 aa  111  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  27.37 
 
 
541 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  26.34 
 
 
538 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  25.51 
 
 
533 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  29.28 
 
 
570 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  24.5 
 
 
492 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  25.47 
 
 
541 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  24.07 
 
 
500 aa  96.3  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  27.27 
 
 
534 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  23.97 
 
 
534 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  25.73 
 
 
463 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  24.2 
 
 
532 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  25.4 
 
 
530 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  24.25 
 
 
525 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.46 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  23.66 
 
 
472 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  27.66 
 
 
578 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  23.49 
 
 
473 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  27.6 
 
 
476 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  27.23 
 
 
481 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  25.37 
 
 
474 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  28.44 
 
 
446 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  23.59 
 
 
484 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  33.82 
 
 
476 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  27.23 
 
 
630 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  23.93 
 
 
539 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>