75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4237 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  100 
 
 
578 aa  1191    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  30.05 
 
 
532 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  27.59 
 
 
536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  25.26 
 
 
499 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  22.87 
 
 
487 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  27.55 
 
 
463 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  25.39 
 
 
492 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  29.49 
 
 
474 aa  87.4  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  29.68 
 
 
546 aa  87  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  26.33 
 
 
474 aa  85.5  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  26.84 
 
 
484 aa  84.3  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  28.01 
 
 
510 aa  83.6  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  25.79 
 
 
515 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  28.93 
 
 
481 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  26.65 
 
 
515 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  27.62 
 
 
500 aa  80.1  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  27.67 
 
 
486 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  24.68 
 
 
482 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  30.3 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  26.8 
 
 
487 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  22.64 
 
 
483 aa  77  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  26.8 
 
 
513 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  25 
 
 
479 aa  76.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  27.66 
 
 
522 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  25.42 
 
 
498 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  23.96 
 
 
476 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  29.08 
 
 
476 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  23.9 
 
 
509 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  24.8 
 
 
514 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  25.94 
 
 
481 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  28.46 
 
 
473 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  29.84 
 
 
472 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  27.82 
 
 
492 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  23.92 
 
 
508 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  27.64 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  32.26 
 
 
511 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.78 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  24.25 
 
 
570 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  23.84 
 
 
506 aa  67.4  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  25.11 
 
 
482 aa  67  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  26.73 
 
 
547 aa  67  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  23.92 
 
 
479 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  27.93 
 
 
520 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  31.06 
 
 
525 aa  63.9  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  24.59 
 
 
488 aa  63.5  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  23.61 
 
 
489 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  27 
 
 
508 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  25.19 
 
 
530 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  25.23 
 
 
500 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  28.57 
 
 
504 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  24.89 
 
 
524 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  23.4 
 
 
531 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  23.89 
 
 
480 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  22.12 
 
 
505 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  29.22 
 
 
510 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  24.36 
 
 
517 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  24.17 
 
 
529 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  24.44 
 
 
526 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  26.98 
 
 
518 aa  55.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  29.29 
 
 
476 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  23.34 
 
 
528 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  23.65 
 
 
533 aa  53.9  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  25.32 
 
 
533 aa  53.9  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  25.87 
 
 
540 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  23.96 
 
 
532 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  26.47 
 
 
538 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  25.52 
 
 
525 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  23.04 
 
 
498 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  24.36 
 
 
526 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  27.59 
 
 
504 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  23.72 
 
 
536 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  23.33 
 
 
541 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  22.74 
 
 
552 aa  44.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  23.29 
 
 
534 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  21.92 
 
 
543 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>