80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1898 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1107    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  34.59 
 
 		 541 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  31.78 
 
 		 532 aa  256  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  32.01 
 
 		 534 aa  249  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  28.88 
 
 		 483 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  28.4 
 
 		 543 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  26.84 
 
 		 489 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  26.21 
 
 		 482 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  27.36 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  27.1 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  28.76 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  27.51 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  24.11 
 
 		 504 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  28.64 
 
 		 508 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  28.46 
 
 		 474 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  27.16 
 
 		 541 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  24.64 
 
 		 526 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  26.99 
 
 		 500 aa  96.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  25.41 
 
 		 476 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  27.27 
 
 		 522 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  26.59 
 
 		 498 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  24.68 
 
 		 532 aa  94  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  27.9 
 
 		 530 aa  93.2  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  27.84 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  23.11 
 
 		 479 aa  92.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  26.73 
 
 		 479 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  26.71 
 
 		 480 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  28.07 
 
 		 498 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  24.81 
 
 		 499 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  26.21 
 
 		 505 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  24.31 
 
 		 520 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  24.26 
 
 		 525 aa  87.4  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  24.66 
 
 		 500 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  24.26 
 
 		 514 aa  87  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  25.11 
 
 		 487 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  26.22 
 
 		 509 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  25.45 
 
 		 538 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  26.53 
 
 		 540 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  24.35 
 
 		 518 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  28.23 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  25.41 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  25.32 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  27.95 
 
 		 489 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  26.3 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  25.9 
 
 		 508 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  24.31 
 
 		 536 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  25.18 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  26.29 
 
 		 506 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  24.81 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  27.79 
 
 		 517 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  24.64 
 
 		 526 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  24.09 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  22.16 
 
 		 524 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  31.82 
 
 		 546 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  26.61 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  26.02 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  25.87 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  25.61 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  22.35 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  25.64 
 
 		 525 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  26.79 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  26.68 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  23.81 
 
 		 484 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  25.58 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  24.64 
 
 		 514 aa  67  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  25.71 
 
 		 547 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  23.98 
 
 		 552 aa  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  25.88 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  25 
 
 		 525 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  25.3 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  31.18 
 
 		 570 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  23.11 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  24.87 
 
 		 528 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  25.05 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  27.46 
 
 		 533 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  23.41 
 
 		 478 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  22.57 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  23.29 
 
 		 578 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  32.11 
 
 		 630 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  20.4 
 
 		 472 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>