87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4811 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  100 
 
 
510 aa  1043    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  57.34 
 
 
508 aa  598  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  53.6 
 
 
514 aa  535  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  50.58 
 
 
513 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  47.32 
 
 
498 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  38.96 
 
 
525 aa  317  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  39.21 
 
 
528 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  36.7 
 
 
506 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  38.87 
 
 
540 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  39.03 
 
 
524 aa  299  7e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  37.76 
 
 
520 aa  293  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  35.21 
 
 
511 aa  289  7e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  35.9 
 
 
504 aa  282  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  34.72 
 
 
510 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  35.58 
 
 
529 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  34.17 
 
 
509 aa  257  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  34.63 
 
 
505 aa  253  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  34.69 
 
 
533 aa  251  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  37.41 
 
 
481 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  32.33 
 
 
498 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  35.37 
 
 
482 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  30.25 
 
 
474 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  29.92 
 
 
486 aa  193  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  31.64 
 
 
476 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  30.54 
 
 
514 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  29.77 
 
 
526 aa  170  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  28.41 
 
 
508 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  27.92 
 
 
492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  29.56 
 
 
517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  29.35 
 
 
488 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  28.31 
 
 
526 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  32.37 
 
 
504 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  27.39 
 
 
479 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  32.84 
 
 
487 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  29.29 
 
 
483 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  27.89 
 
 
522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  26.6 
 
 
489 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  26.67 
 
 
500 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  26.25 
 
 
518 aa  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  28.81 
 
 
547 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  28.71 
 
 
488 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  28.97 
 
 
525 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  27.68 
 
 
482 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  27.8 
 
 
489 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  26.37 
 
 
480 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  25.62 
 
 
543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  27.74 
 
 
532 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  30 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  28.08 
 
 
530 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  25.9 
 
 
536 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  29.81 
 
 
515 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  26.62 
 
 
479 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  27.7 
 
 
515 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  25.56 
 
 
546 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0615  hypothetical protein  28.4 
 
 
528 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  27.38 
 
 
552 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  27.27 
 
 
499 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  26.02 
 
 
531 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0802  hypothetical protein  28 
 
 
538 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  25.28 
 
 
570 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0329  hypothetical protein  26.79 
 
 
541 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  25.09 
 
 
532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  24.49 
 
 
533 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  24.33 
 
 
536 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  26.19 
 
 
500 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  24.6 
 
 
525 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  27.56 
 
 
474 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  25.73 
 
 
463 aa  96.7  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  25.7 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  25.87 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3039  hypothetical protein  25.59 
 
 
534 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  25.63 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1894  hypothetical protein  37.31 
 
 
630 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4176  hypothetical protein  25.62 
 
 
532 aa  84.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.233001  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  25.48 
 
 
484 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7181  hypothetical protein  24.76 
 
 
541 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  25.18 
 
 
473 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1898  hypothetical protein  26.79 
 
 
534 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00446967  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  23.99 
 
 
492 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4130  hypothetical protein  23.75 
 
 
539 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.665943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  29.22 
 
 
578 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  26.07 
 
 
481 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 
523 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  32.03 
 
 
476 aa  50.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 
539 aa  47.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  24.4 
 
 
664 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  34.41 
 
 
476 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>